Interpretação e Relato de Resultados

A interpretação e o relato são as etapas que transformam dados genéticos brutos em uma declaração clinicamente utilizável. Os alelos detectados são nomeados, combinados em um diplotipo e traduzidos em um fenótipo previsto, como uma categoria de metabolizador; esse fenótipo é então comunicado em um relatório usando termos padronizados. Como a terminologia inconsistente já dificultou a comparação e a ação com base em relatórios farmacogenômicos, a terminologia de consenso e as regras de tradução são centrais para este tópico.

Definition

A interpretação e o relato de resultados farmacogenômicos é o processo de converter alelos detectados em um diplotipo e um fenótipo de resposta a medicamentos previsto, e então comunicar esse fenótipo em um relatório clínico usando terminologia padronizada e baseada em consenso.

Scope

Esta entrada aborda a tradução genótipo-fenótipo, as categorias de fenótipo padronizadas usadas para descrever a resposta a medicamentos, a terminologia de consenso para resultados farmacogenéticos clínicos e por que a padronização é importante para a clareza entre laboratórios e sistemas de suporte à decisão. Ela usa a tradução do CYP2D6 como um caso ilustrativo da complexidade envolvida. É uma descrição de referência da prática de interpretação e relato, não um guia para agir com base em qualquer resultado específico.

Core questions

• Como um genótipo é traduzido em um fenótipo previsto?
• Quais termos padronizados descrevem os fenótipos de resposta a medicamentos e por que foram acordados?
• Por que a terminologia consistente é importante entre laboratórios e sistemas?
• O que torna a tradução para genes como o CYP2D6 especialmente complexa?

Key concepts

• Montagem de diplotipo
• Tradução genótipo-fenótipo
• Categorias de fenótipo de metabolizador
• Terminologia padronizada de resultados
• Pontuações de atividade para genes complexos
• Clareza e comparabilidade do relatório

Mechanisms

Após um laboratório detectar variantes, os alelos são nomeados usando a nomenclatura de alelos-estrela e combinados em um diplotipo (Gaedigk et al., 2017). O diplotipo é mapeado para um fenótipo previsto, frequentemente expresso como uma categoria de metabolizador, usando regras de tradução de consenso; para genes complexos como o CYP2D6, uma abordagem de pontuação de atividade soma as contribuições funcionais de cada alelo antes de atribuir um fenótipo (Caudle et al., 2019). O fenótipo previsto é então relatado usando termos padronizados acordados por consórcios para que o mesmo genótipo produza a mesma linguagem descritiva, independentemente do laboratório (Caudle et al., 2017). A terminologia padronizada e as regras de tradução permitem que os sistemas de suporte à decisão a jusante interpretem os relatórios de forma consistente e reduzam a ambiguidade para os médicos (Roden, 2019).

Clinical relevance

A interpretação clara e padronizada permite que os leitores compreendam o que um relatório farmacogenômico está afirmando sobre a resposta prevista a medicamentos e com que confiança. Compreender como um genótipo se torna um fenótipo relatado faz parte da avaliação de tais relatórios. Esta entrada explica o processo de relato e a terminologia; ela não interpreta nenhum resultado individual nem traduz um fenótipo em uma decisão de prescrição ou dosagem.

Evidence & guidelines

A terminologia de consenso para resultados de testes farmacogenéticos clínicos foi estabelecida pelo Clinical Pharmacogenetics Implementation Consortium para harmonizar a forma como os fenótipos são relatados (Caudle et al., 2017), e as recomendações conjuntas do CPIC e do Dutch Pharmacogenetics Working Group padronizaram a tradução genótipo-fenótipo para o CYP2D6 (Caudle et al., 2019). As definições de alelos que sustentam essas traduções são curadas pelo Pharmacogene Variation Consortium (Gaedigk et al., 2017). Essas são estruturas de padronização, não aconselhamento clínico individualizado.

History

Os primeiros relatórios farmacogenômicos variavam amplamente na forma como descreviam os fenótipos, o que dificultava a comparação e o suporte à decisão. Para resolver isso, o Clinical Pharmacogenetics Implementation Consortium publicou termos de consenso para resultados de testes farmacogenéticos clínicos em 2017 (Caudle et al., 2017), e um esforço conjunto com o Dutch Pharmacogenetics Working Group padronizou posteriormente a tradução para o difícil gene CYP2D6 (Caudle et al., 2019). Esses esforços, baseados na nomenclatura de alelos curada por consórcios (Gaedigk et al., 2017), tornaram os relatórios mais uniformes em todo o campo.

Debates

Padronização de categorias de fenótipos para genes complexos

Atribuir um único fenótipo a genes altamente variáveis, como o CYP2D6, é difícil, e o consenso sobre os limiares de pontuação de atividade e os limites de fenótipo exigiu harmonização explícita entre as principais estruturas.

Key figures

• Kelly E. Caudle
• Andrea Gaedigk
• Michelle Whirl-Carrillo
• James M. Hoffman

Seminal works

• caudle-2017
• caudle-2019
• gaedigk-2017

Frequently asked questions

O que é um fenótipo de metabolizador?

É uma categoria prevista que descreve como se espera que uma pessoa processe certos medicamentos com base em seu genótipo, como metabolizador pobre, intermediário, normal ou ultrarrápido; é uma previsão derivada do resultado genético, não uma medição direta dos níveis de medicamentos.

Por que a terminologia padronizada é importante?

Termos consistentes garantem que o mesmo genótipo seja descrito da mesma forma em diferentes laboratórios e sistemas de suporte à decisão, reduzindo a ambiguidade e tornando os relatórios mais fáceis de comparar e de agir de forma apropriada.