फार्माकोजेनोमिक्स अनुसंधान में प्रतिनिधित्व पूर्वाग्रह

प्रतिनिधित्व पूर्वाग्रह कुछ आबादी - मुख्य रूप से यूरोपीय वंश के लोगों - के व्यवस्थित अति-प्रतिनिधित्व और फार्माकोजेनोमिक्स को आधार बनाने वाले समूहों, संदर्भ डेटाबेस और सत्यापन अध्ययनों में दूसरों के अल्प-प्रतिनिधित्व को संदर्भित करता है। चूंकि फार्माकोजेनेटिक खोज और एनोटेशन अध्ययन की गई आबादी के अनुसार कैलिब्रेट किए जाते हैं, यह असंतुलन अल्प-प्रतिनिधित्व वाले समूहों के लिए साक्ष्य आधार को कम पूर्ण और कम विश्वसनीय बनाता है।

Definition

फार्माकोजेनोमिक साक्ष्य में व्यवस्थित विचलन जिसके तहत खोज समूह, संदर्भ पैनल और सत्यापन अध्ययन विशेष आबादी - मुख्य रूप से यूरोपीय-वंश - का असमान रूप से नमूना लेते हैं, जिससे ऐसे निष्कर्ष और उपकरण उत्पन्न होते हैं जो मानवता में असमान रूप से सामान्यीकृत होते हैं।

Scope

यह विषय जीनोमिक और फार्माकोजेनोमिक अनुसंधान में विविधता अंतर के पैमाने, उन तंत्रों जिनके द्वारा यह निष्कर्षों को पूर्वाग्रहित करता है, और इक्विटी के लिए इसके डाउनस्ट्रीम परिणामों का दस्तावेजीकरण करता है। यह एक कार्यप्रणाली और संदर्भ अवलोकन है; यह कोई नैदानिक ​​सिफारिशें प्रदान नहीं करता है।

Core questions

• जीनोमिक और फार्माकोजेनोमिक अनुसंधान में आबादी का प्रतिनिधित्व कितना असमान है?
• किन तंत्रों के माध्यम से अल्प-प्रतिनिधित्व खोज, एनोटेशन और सत्यापन को पूर्वाग्रहित करता है?
• विविधता अंतर के इक्विटी परिणाम क्या हैं?
• कौन सी पहलें जीनोमिक डेटा की विविधता का विस्तार कर रही हैं?
• प्रतिनिधित्व पूर्वाग्रह आनुवंशिक भविष्यवक्ताओं की हस्तांतरणीयता के साथ कैसे बातचीत करता है?

Key concepts

• अति-प्रतिनिधित्व और अल्प-प्रतिनिधित्व
• निर्धारण पूर्वाग्रह
• संदर्भ पैनल संरचना
• भविष्यवक्ताओं की हस्तांतरणीयता (पोर्टेबिलिटी)
• वेरिएंट व्याख्या और पुनर्वर्गीकरण
• विविध बायोबैंक और संघ (जैसे, TOPMed, H3Africa, All of Us)
• स्वास्थ्य असमानताएं

Mechanisms

पूर्वाग्रह कई चरणों में प्रवेश करता है। मुख्य रूप से यूरोपीय-वंश के प्रतिभागियों से लिए गए खोज समूह उस समूह में सामान्य वेरिएंट की पहचान करते हैं, इसलिए कहीं और प्रचलित वेरिएंट के पाए जाने या कार्यात्मक रूप से एनोटेट होने की संभावना कम होती है। तिरछे डेटा से एकत्रित संदर्भ पैनल अच्छी तरह से प्रतिनिधित्व वाली आबादी के लिए भिन्नता को बेहतर ढंग से अनुमानित और व्याख्या करते हैं। उन्हीं समूहों में किए गए सत्यापन अध्ययन वहां प्रदर्शन की पुष्टि करते हैं लेकिन अन्यत्र सामान्यीकरण का परीक्षण नहीं करते हैं। परिणामस्वरूप, आनुवंशिक भविष्यवक्ता - जिनमें पॉलीजेनिक स्कोर शामिल हैं - अल्प-प्रतिनिधित्व वाली आबादी में खराब रूप से स्थानांतरित होते हैं, और उन आबादी में वेरिएंट को अक्सर अनिश्चित महत्व के रूप में वर्गीकृत किया जाता है। अफ्रीकी आबादी, जिसमें सबसे अधिक आनुवंशिक विविधता है, विशेष रूप से प्रभावित होती है क्योंकि उनकी अधिकांश भिन्नता यूरोपीय-केंद्रित संसाधनों से बस अनुपस्थित है।

Clinical relevance

प्रतिनिधित्व पूर्वाग्रह यह तय करने के लिए केंद्रीय है कि किसी दी गई आबादी के लिए फार्माकोजेनोमिक खोज या उपकरण विश्वसनीय है या नहीं। यह प्रविष्टि बताती है कि पूर्वाग्रह कैसे उत्पन्न होता है और साक्ष्य की पूर्णता के लिए इसका क्या अर्थ है; यह नैदानिक ​​मार्गदर्शन नहीं है और व्यक्तियों के लिए परीक्षण या उपचार को संबोधित नहीं करता है।

Epidemiology

जीनोम-व्यापी संघ और जीनोमिक अध्ययनों के ऑडिट में बार-बार पाया गया है कि यूरोपीय वंश के प्रतिभागी अध्ययन किए गए लोगों का एक बड़ा बहुमत बनाते हैं - वैश्विक आबादी में उनके हिस्से से कहीं अधिक - जबकि अफ्रीकी, लैटिन अमेरिकी, और कई एशियाई और स्वदेशी आबादी उल्लेखनीय रूप से अल्प-प्रतिनिधित्व वाली बनी हुई हैं, एक अंतर जो निरंतर ध्यान के बावजूद धीरे-धीरे ही कम हुआ है।

History

जीनोमिक्स में विविधता की कमी के बारे में चिंता पोपजॉय और फुलर्टन के 2016 के विश्लेषण से स्पष्ट हुई, जिसमें यूरोपीय-वंश के प्रतिभागियों का प्रभुत्व दिखाया गया, और सिरुगो और सहयोगियों के 2019 के समीक्षा द्वारा पुष्ट हुई, जिसमें अंतर की निरंतरता का दस्तावेजीकरण किया गया। मार्टिन और सहयोगियों (2019) ने एक ठोस नुकसान का प्रदर्शन किया - गैर-यूरोपीय आबादी में पॉलीजेनिक स्कोर का खराब और संभावित रूप से असमानता-बढ़ाने वाला प्रदर्शन। NHLBI TOPMed कार्यक्रम, H3Africa, और बड़े विविध बायोबैंक जैसी पहलें आंशिक रूप से असंतुलन को दूर करने के लिए उभरीं।

Debates

ध्यान के बावजूद विविधता अंतर क्यों बना हुआ है?

स्पष्टीकरणों में गहरी जड़ें जमाई हुई भर्ती अवसंरचना, धन पैटर्न, हाशिए पर पड़े समुदायों के बीच ऐतिहासिक अविश्वास, और कार्यप्रणाली सुविधा शामिल हैं; टिप्पणीकार इस बात पर असहमत हैं कि कौन से लीवर अंतर को सबसे प्रभावी ढंग से बंद करते हैं।

Key figures

• Alice B. Popejoy
• Stephanie M. Fullerton
• Sarah Tishkoff
• Alicia R. Martin
• Charles Rotimi

Seminal works

• popejoy-2016
• sirugo-2019
• martin-2019

Frequently asked questions

यह क्यों मायने रखता है कि अधिकांश जीनोमिक अनुसंधान यूरोपीय-वंश की आबादी में है?

फार्माकोजेनोमिक खोज, वेरिएंट व्याख्या, और भविष्य कहनेवाला उपकरण अध्ययन की गई आबादी के अनुसार कैलिब्रेट किए जाते हैं। जब वे मुख्य रूप से यूरोपीय-वंश के होते हैं, तो परिणामी ज्ञान अन्य आबादी के लिए कम पूर्ण और कम विश्वसनीय होता है, जिससे स्वास्थ्य असमानताओं में योगदान होता है।

क्या विविध डेटा जोड़ने से समस्या ठीक हो जाती है?

समूहों और संदर्भ पैनलों की विविधता का विस्तार करना आवश्यक है और मदद करता है, लेकिन इसे विश्लेषणात्मक तरीकों के साथ जोड़ा जाना चाहिए जो आबादी में स्थानांतरित होते हैं और सामुदायिक विश्वास और न्यायसंगत लाभ पर ध्यान देते हैं।