फार्माकोजेनोमिक परीक्षण और नैदानिक कार्यान्वयन

फार्माकोजेनोमिक परीक्षण और नैदानिक कार्यान्वयन फार्माकोजेनोमिक्स का अनुप्रयुक्त पक्ष है: दवा-प्रबंधन और दवा-लक्ष्य जीनों में वंशानुगत भिन्नता को रोगी के नमूने में कैसे मापा जाता है, एक अनुमानित दवा-प्रतिक्रिया फेनोटाइप में अनुवादित किया जाता है, और चिकित्सकों को एक उपयोगी रूप में वितरित किया जाता है। इसमें प्रयोगशाला प्रौद्योगिकियां शामिल हैं जो वेरिएंट का पता लगाती हैं, साक्ष्य ढाँचे जो यह तय करते हैं कि कौन से जीन-दवा जोड़े कार्रवाई योग्य हैं, परीक्षण कब करना है इसके मॉडल, परिणामों की रिपोर्टिंग के लिए मानक, और इलेक्ट्रॉनिक सिस्टम जो नुस्खे के बिंदु पर मार्गदर्शन प्रदान करते हैं।

Definition

फार्माकोजेनोमिक परीक्षण और नैदानिक कार्यान्वयन प्रयोगशाला, व्याख्यात्मक और सूचना विज्ञान प्रक्रियाओं का एक समूह है जिसके द्वारा दवा प्रतिक्रिया को प्रभावित करने वाली आनुवंशिक भिन्नता का पता लगाया जाता है, एक फेनोटाइप में वर्गीकृत किया जाता है, रिपोर्ट किया जाता है, और नुस्खे के निर्णयों को सूचित करने के लिए नैदानिक कार्यप्रवाहों में एकीकृत किया जाता है।

Scope

यह क्षेत्र पाठक को आनुवंशिक परीक्षण से नैदानिक कार्रवाई तक की संपूर्ण प्रक्रिया से परिचित कराता है। यह फार्माकोजेनोमिक प्रयोगशालाओं में उपयोग की जाने वाली जीनोटाइपिंग और अनुक्रमण प्रौद्योगिकियों, दिशानिर्देश और साक्ष्य-स्तर के ढाँचों (विशेष रूप से क्लिनिकल फार्माकोजेनेटिक्स इम्प्लीमेंटेशन कंसोर्टियम के), पूर्व-खाली और प्रतिक्रियात्मक परीक्षण के बीच रणनीतिक चुनाव, परिणामों की व्याख्या और मानकीकृत रिपोर्टिंग, और नैदानिक निर्णय समर्थन प्रणालियों का परिचय देता है जो इलेक्ट्रॉनिक स्वास्थ्य रिकॉर्ड में फार्माकोजेनोमिक अलर्ट को एम्बेड करते हैं। यह इन्हें कार्यान्वयन विज्ञान और प्रयोगशाला चिकित्सा में संदर्भ विषयों के रूप में मानता है, न कि नैदानिक निर्देशों के रूप में।

Sub-topics

• नैदानिक निर्णय समर्थन प्रणालियाँ
• सीपीआईसी दिशानिर्देश और साक्ष्य स्तर
• जीनोटाइपिंग और अनुक्रमण प्रौद्योगिकियाँ
• परिणामों की व्याख्या और रिपोर्टिंग
• पूर्व-सक्रिय बनाम प्रतिक्रियात्मक जीनोटाइपिंग

Core questions

• फार्माकोजीन में आनुवंशिक भिन्नता का पता कैसे लगाया जाता है, और विभिन्न प्रौद्योगिकियां क्या पकड़ती हैं या छोड़ देती हैं?
• किन जीन-दवा जोड़ों के पास चिकित्सकीय रूप से कार्रवाई योग्य होने के लिए पर्याप्त सबूत हैं, और कौन निर्णय लेता है?
• क्या जीनोटाइपिंग को जनसंख्या भर में पूर्व-खाली रूप से किया जाना चाहिए या किसी दवा पर विचार करते समय प्रतिक्रियात्मक रूप से परीक्षण किया जाना चाहिए?
• कच्चे जीनोटाइप को मानकीकृत फेनोटाइप में कैसे अनुवादित किया जाता है और एक नैदानिक रिपोर्ट में कैसे संप्रेषित किया जाता है?
• अलर्ट थकान के बिना फार्माकोजेनोमिक मार्गदर्शन को निर्धारित करने वालों तक विश्वसनीय रूप से कैसे पहुंचाया जा सकता है?

Key concepts

• जीन-दवा जोड़ी की कार्रवाई क्षमता
• जीनोटाइप-से-फेनोटाइप अनुवाद
• स्टार (*) एलील नामकरण
• पूर्व-खाली बनाम प्रतिक्रियात्मक परीक्षण
• नैदानिक निर्णय समर्थन और इलेक्ट्रॉनिक स्वास्थ्य रिकॉर्ड
• साक्ष्य स्तर और दिशानिर्देश की शक्ति
• मानकीकृत परिणाम शब्दावली

Mechanisms

कार्यान्वयन एक पाइपलाइन का अनुसरण करता है। एक प्रयोगशाला लक्षित जीनोटाइपिंग सरणियों या अनुक्रमण का उपयोग करके फार्माकोजीन में वेरिएंट का पता लगाती है; पता लगाए गए एलील्स को स्टार-एलील नामकरण का उपयोग करके नामित किया जाता है और एक डिप्लोटाइप में संयोजित किया जाता है। डिप्लोटाइप को आम सहमति नियमों का उपयोग करके एक अनुमानित मेटाबोलाइज़र या प्रतिक्रिया फेनोटाइप में अनुवादित किया जाता है। क्लिनिकल फार्माकोजेनेटिक्स इम्प्लीमेंटेशन कंसोर्टियम जैसे साक्ष्य ढाँचे यह मूल्यांकन करते हैं कि किन जीन-दवा जोड़ों के पास कार्रवाई योग्य होने के लिए पर्याप्त सबूत हैं और यह मार्गदर्शन प्रकाशित करते हैं कि एक दिया गया फेनोटाइप दवा प्रतिक्रिया से कैसे संबंधित है। परिणाम को मानकीकृत शब्दों के साथ रिपोर्ट किया जाता है और, तेजी से, इलेक्ट्रॉनिक स्वास्थ्य रिकॉर्ड में संग्रहीत किया जाता है ताकि नैदानिक निर्णय समर्थन प्रासंगिक मार्गदर्शन प्रस्तुत कर सके जब एक प्रभावित दवा निर्धारित की जाती है (रोडेन, 2019; रेलिंग और क्लेन, 2011; रेलिंग एट अल।, 2019)।

Clinical relevance

फार्माकोजेनोमिक कार्यान्वयन उस बुनियादी ढांचे का वर्णन करता है जिसके माध्यम से दवा प्रतिक्रिया के बारे में आनुवंशिक जानकारी नैदानिक देखभाल तक पहुंच सकती है; इसे समझना चिकित्सकों, प्रयोगशाला विशेषज्ञों और सूचना विज्ञानियों को यह मूल्यांकन करने में मदद करता है कि एक फार्माकोजेनोमिक रिपोर्ट क्या समर्थन कर सकती है और क्या नहीं। यहां के विषय यह दर्शाते हैं कि साक्ष्य और परिणाम कैसे उत्पन्न होते हैं, मानकीकृत होते हैं और वितरित किए जाते हैं, और इन्हें व्यक्तिगत नुस्खे या खुराक के निर्णयों के स्रोत के बजाय एक संदर्भ अभिविन्यास के रूप में अभिप्रेत किया गया है।

Evidence & guidelines

इस क्षेत्र में प्रमुख साक्ष्य ढाँचा क्लिनिकल फार्माकोजेनेटिक्स इम्प्लीमेंटेशन कंसोर्टियम (CPIC) है, जो जीन-दवा साक्ष्य की शक्ति को ग्रेड करता है और एक स्थापित जीनोटाइप पर कैसे कार्य करना है, इसका वर्णन करने वाले सहकर्मी-समीक्षित दिशानिर्देश जारी करता है; डच फार्माकोजेनेटिक्स वर्किंग ग्रुप एक समानांतर यूरोपीय ढाँचा प्रदान करता है (रेलिंग और क्लेन, 2011; रेलिंग एट अल।, 2019)। वेंडरबिल्ट प्रेडिक्ट परियोजना जैसे बड़े संभावित कार्यक्रमों ने जीनोटाइपिंग और निर्णय समर्थन को नियमित देखभाल में एम्बेड करने के लिए परिचालन मॉडल का प्रदर्शन किया (पुले एट अल।, 2012)। ये ढाँचे साक्ष्य और प्रक्रिया का वर्णन करते हैं; वे नैदानिक निर्णय का विकल्प नहीं हैं।

History

फार्माकोजेनोमिक कार्यान्वयन दशकों के फार्माकोजेनेटिक्स अनुसंधान से 2010 के दशक में एक संगठित नैदानिक अनुशासन के रूप में विकसित हुआ। 2009 में क्लिनिकल फार्माकोजेनेटिक्स इम्प्लीमेंटेशन कंसोर्टियम की स्थापना ने जीन-दवा संघों को कार्रवाई योग्य दिशानिर्देशों में बदलने के लिए एक साझा ढाँचा प्रदान किया (रेलिंग और क्लेन, 2011), और वेंडरबिल्ट की प्रेडिक्ट परियोजना जैसे शुरुआती संस्थागत कार्यक्रमों ने दिखाया कि संभावित जीनोटाइपिंग और इलेक्ट्रॉनिक निर्णय समर्थन को कैसे संचालित किया जा सकता है (पुले एट अल।, 2012)। एक दशक बाद, यह क्षेत्र मानकीकृत शब्दावली और बढ़ते इलेक्ट्रॉनिक-स्वास्थ्य-रिकॉर्ड एकीकरण के साथ एक पहचानने योग्य कार्यान्वयन विज्ञान में परिपक्व हो गया था (रेलिंग एट अल।, 2019; रोडेन, 2019)।

Debates

पूर्व-खाली बनाम प्रतिक्रियात्मक परीक्षण

रोगी का पहले से जीनोटाइप करना ताकि कोई भी दवा निर्धारित करने से पहले परिणाम उपलब्ध हों, या केवल तभी प्रतिक्रियात्मक रूप से परीक्षण करना जब किसी विशिष्ट दवा पर विचार किया जा रहा हो, इसमें लागत, डेटा की तैयारी और नैदानिक उपज में व्यापार-बंद शामिल हैं जिन पर सक्रिय रूप से चर्चा जारी है।

Key figures

• Mary V. Relling
• Teri E. Klein
• Dan M. Roden
• Kelly E. Caudle
• Josh F. Peterson

Seminal works

• relling-2011
• pulley-2012
• relling-2019
• roden-2019

Frequently asked questions

फार्माकोजेनेटिक और फार्माकोजेनोमिक परीक्षण में क्या अंतर है?

फार्माकोजेनेटिक्स ऐतिहासिक रूप से एकल जीन-दवा संबंधों को संदर्भित करता है जबकि फार्माकोजेनोमिक्स दवा प्रतिक्रिया पर जीनोम-व्यापी प्रभावों को कवर करता है; नैदानिक कार्यान्वयन में इन शब्दों का अब आनुवंशिक भिन्नता से दवा प्रतिक्रिया की भविष्यवाणी करने वाले परीक्षण के लिए बड़े पैमाने पर एक दूसरे के स्थान पर उपयोग किया जाता है।

क्या एक फार्माकोजेनोमिक परीक्षण एक चिकित्सक को ठीक-ठीक बताता है कि क्या निर्धारित करना है?

नहीं। एक परीक्षण एक अनुमानित फेनोटाइप की रिपोर्ट करता है; इसे एक नुस्खे के निर्णय में बदलना साक्ष्य-आधारित दिशानिर्देशों और नैदानिक निर्णय पर निर्भर करता है जो पूरे रोगी को ध्यान में रखता है, और अकेले परीक्षण का परिणाम उपचार निर्देश नहीं है।