परिणामों की व्याख्या और रिपोर्टिंग

व्याख्या और रिपोर्टिंग वह चरण है जो कच्चे आनुवंशिक डेटा को चिकित्सकीय रूप से उपयोग योग्य कथन में बदलता है। पता लगाए गए एलील्स का नामकरण किया जाता है, उन्हें एक डिप्लोटाइप में संयोजित किया जाता है, और एक अनुमानित फेनोटाइप में अनुवादित किया जाता है जैसे कि एक मेटाबोलाइज़र श्रेणी; उस फेनोटाइप को फिर मानकीकृत शब्दों का उपयोग करके एक रिपोर्ट में संप्रेषित किया जाता है। क्योंकि असंगत शब्दावली ने एक बार फार्माकोजेनोमिक रिपोर्टों की तुलना करना और उन पर कार्य करना मुश्किल बना दिया था, इसलिए इस विषय के लिए आम सहमति वाली शब्दावली और अनुवाद नियम केंद्रीय हैं।

Definition

फार्माकोजेनोमिक परिणामों की व्याख्या और रिपोर्टिंग, पता लगाए गए एलील्स को एक डिप्लोटाइप और एक अनुमानित दवा-प्रतिक्रिया फेनोटाइप में परिवर्तित करने की प्रक्रिया है, फिर उस फेनोटाइप को मानकीकृत, आम सहमति-आधारित शब्दावली का उपयोग करके एक नैदानिक रिपोर्ट में संप्रेषित करना है।

Scope

यह प्रविष्टि जीनोटाइप-से-फेनोटाइप अनुवाद, दवा प्रतिक्रिया का वर्णन करने के लिए उपयोग की जाने वाली मानकीकृत फेनोटाइप श्रेणियों, नैदानिक फार्माकोजेनेटिक परिणामों के लिए आम सहमति वाली शब्दावली, और प्रयोगशालाओं और निर्णय-समर्थन प्रणालियों में स्पष्टता के लिए मानकीकरण क्यों मायने रखता है, को शामिल करती है। यह इसमें शामिल जटिलता के एक उदाहरणात्मक मामले के रूप में CYP2D6 अनुवाद का उपयोग करता है। यह व्याख्या और रिपोर्टिंग अभ्यास का एक संदर्भ विवरण है, किसी विशिष्ट परिणाम पर कार्य करने के लिए एक मार्गदर्शिका नहीं।

Core questions

• एक जीनोटाइप को अनुमानित फेनोटाइप में कैसे अनुवादित किया जाता है?
• दवा-प्रतिक्रिया फेनोटाइप का वर्णन करने वाले मानकीकृत शब्द क्या हैं, और उन्हें क्यों सहमत किया गया?
• प्रयोगशालाओं और प्रणालियों में सुसंगत शब्दावली क्यों महत्वपूर्ण है?
• CYP2D6 जैसे जीनों के लिए अनुवाद को विशेष रूप से जटिल क्या बनाता है?

Key concepts

• डिप्लोटाइप असेंबली
• जीनोटाइप-से-फेनोटाइप अनुवाद
• मेटाबोलाइज़र फेनोटाइप श्रेणियाँ
• मानकीकृत परिणाम शब्दावली
• जटिल जीनों के लिए गतिविधि स्कोर
• रिपोर्ट की स्पष्टता और तुलनीयता

Mechanisms

एक प्रयोगशाला द्वारा वेरिएंट का पता लगाने के बाद, एलील्स का नाम स्टार-एलील नामकरण का उपयोग करके किया जाता है और उन्हें एक डिप्लोटाइप में संयोजित किया जाता है (Gaedigk et al., 2017)। डिप्लोटाइप को एक अनुमानित फेनोटाइप में मैप किया जाता है, जिसे अक्सर मेटाबोलाइज़र श्रेणी के रूप में व्यक्त किया जाता है, आम सहमति अनुवाद नियमों का उपयोग करके; CYP2D6 जैसे जटिल जीनों के लिए एक गतिविधि-स्कोर दृष्टिकोण एक फेनोटाइप असाइन करने से पहले प्रत्येक एलील के कार्यात्मक योगदान को जोड़ता है (Caudle et al., 2019)। अनुमानित फेनोटाइप को फिर संघों द्वारा सहमत मानकीकृत शब्दों का उपयोग करके रिपोर्ट किया जाता है ताकि एक ही जीनोटाइप प्रयोगशाला की परवाह किए बिना समान वर्णनात्मक भाषा उत्पन्न करे (Caudle et al., 2017)। मानकीकृत शब्दावली और अनुवाद नियम डाउनस्ट्रीम निर्णय-समर्थन प्रणालियों को रिपोर्टों की लगातार व्याख्या करने और चिकित्सकों के लिए अस्पष्टता को कम करने की अनुमति देते हैं (Roden, 2019)।

Clinical relevance

स्पष्ट, मानकीकृत व्याख्या पाठकों को यह समझने देती है कि एक फार्माकोजेनोमिक रिपोर्ट अनुमानित दवा प्रतिक्रिया के बारे में क्या दावा कर रही है और कितनी निश्चितता के साथ। यह समझना कि एक जीनोटाइप एक रिपोर्टेड फेनोटाइप कैसे बनता है, ऐसी रिपोर्टों का मूल्यांकन करने का एक हिस्सा है। यह प्रविष्टि रिपोर्टिंग प्रक्रिया और शब्दावली की व्याख्या करती है; यह किसी भी व्यक्तिगत परिणाम की व्याख्या नहीं करती है या एक फेनोटाइप को निर्धारित करने या खुराक के निर्णय में अनुवाद नहीं करती है।

Evidence & guidelines

नैदानिक फार्माकोजेनेटिक परीक्षण परिणामों के लिए आम सहमति वाली शब्दावली क्लिनिकल फार्माकोजेनेटिक्स इम्प्लीमेंटेशन कंसोर्टियम द्वारा स्थापित की गई थी ताकि फेनोटाइप्स को कैसे रिपोर्ट किया जाए, इसे सुसंगत बनाया जा सके (Caudle et al., 2017), और संयुक्त CPIC और डच फार्माकोजेनेटिक्स वर्किंग ग्रुप की सिफारिशों ने CYP2D6 के लिए जीनोटाइप-से-फेनोटाइप अनुवाद को मानकीकृत किया (Caudle et al., 2019)। इन अनुवादों को रेखांकित करने वाली एलील परिभाषाओं को फार्माकोजीन वेरिएशन कंसोर्टियम द्वारा क्यूरेट किया जाता है (Gaedigk et al., 2017)। ये मानकीकरण ढाँचे हैं, न कि व्यक्तिगत नैदानिक सलाह।

History

प्रारंभिक फार्माकोजेनोमिक रिपोर्टें फेनोटाइप्स का वर्णन करने के तरीके में व्यापक रूप से भिन्न थीं, जिसने तुलना और निर्णय समर्थन में बाधा डाली। इसे संबोधित करने के लिए, क्लिनिकल फार्माकोजेनेटिक्स इम्प्लीमेंटेशन कंसोर्टियम ने 2017 में नैदानिक फार्माकोजेनेटिक परीक्षण परिणामों के लिए आम सहमति वाले शब्द प्रकाशित किए (Caudle et al., 2017), और डच फार्माकोजेनेटिक्स वर्किंग ग्रुप के साथ एक संयुक्त प्रयास ने बाद में कठिन CYP2D6 जीन के लिए अनुवाद को मानकीकृत किया (Caudle et al., 2019)। कंसोर्टियम-क्यूरेटेड एलील नामकरण (Gaedigk et al., 2017) पर निर्मित इन प्रयासों ने पूरे क्षेत्र में रिपोर्टिंग को अधिक समान बना दिया।

Debates

जटिल जीनों के लिए फेनोटाइप श्रेणियों का मानकीकरण

CYP2D6 जैसे अत्यधिक परिवर्तनशील जीनों को एक एकल फेनोटाइप असाइन करना मुश्किल है, और गतिविधि-स्कोर थ्रेसहोल्ड और फेनोटाइप सीमाओं पर आम सहमति के लिए प्रमुख ढाँचों के बीच स्पष्ट सामंजस्य की आवश्यकता थी।

Key figures

• Kelly E. Caudle
• Andrea Gaedigk
• Michelle Whirl-Carrillo
• James M. Hoffman

Seminal works

• caudle-2017
• caudle-2019
• gaedigk-2017

Frequently asked questions

मेटाबोलाइज़र फेनोटाइप क्या है?

यह एक अनुमानित श्रेणी है जो बताती है कि एक व्यक्ति अपने जीनोटाइप के आधार पर कुछ दवाओं को कैसे संसाधित करने की उम्मीद करता है, जैसे कि खराब, मध्यवर्ती, सामान्य, या अल्ट्रा-रैपिड मेटाबोलाइज़र; यह आनुवंशिक परिणाम से प्राप्त एक भविष्यवाणी है, न कि दवा के स्तर का सीधा माप।

मानकीकृत शब्दावली क्यों मायने रखती है?

सुसंगत शब्द यह सुनिश्चित करते हैं कि एक ही जीनोटाइप को प्रयोगशालाओं और निर्णय-समर्थन प्रणालियों में एक ही तरीके से वर्णित किया जाए, जिससे अस्पष्टता कम होती है और रिपोर्टों की तुलना करना और उन पर उचित रूप से कार्य करना आसान हो जाता है।