ניתוח העשרת קבוצות גנים מבוסס-רשת
ניתוח העשרת קבוצות גנים מבוסס-רשת (network GSEA) מרחיב את GSEA הקלאסי על ידי שילוב רשתות אינטראקציה ביולוגיות — כגון אינטראקציות חלבון-חלבון (PPI) או גרפים של ביטוי משותף — במבחן ההעשרה. במקום להתייחס לכל גן באופן עצמאי, השיטה מפיצה אותות ביטוי דיפרנציאלי לאורך קצוות הרשת, ומאפשרת לגנים המבוקרים במשותף או המחוברים תפקודית לתמוך יחד במובהקות של קבוצת גנים. התוצאה היא ציון העשרה קוהרנטי ביולוגית הלוקח בחשבון את טופולוגיית המסלול ואת התלות בין גנים.
קראו את השיטה במלואה
התחברו עם חשבון חינמי כדי לקרוא חלק זה.
מפת שיטות
סביבת השיטות הקרובות — בחרו צומת כדי לחקור.
מקורות
- Shojaie, A., & Michailidis, G. (2010). Network enrichment analysis in complex experiments. Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology, 9(1), Article 22. link ↗
- Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545-15550. link ↗
איך לצטט עמוד זה
ScholarGate. (2026, June 3). Network-Based Gene Set Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/he/bioinformatics/network-based-gene-set-enrichment-analysis
איזו שיטה?
הציבו שיטה זו לצד קרובותיה הקרובות וקראו אותן זו לצד זו — הספרייה מניחה את הספרים על השולחן; הבחירה בידיכם.
- ניתוח העשרת קבוצת גנים (GSEA)ביואינפורמטיקה↔ השוואה
- GWAS מבוסס-רשתביואינפורמטיקה↔ השוואה
- ניתוח העשרת מסלוליםביואינפורמטיקה↔ השוואה
- ניתוח ביטוי דיפרנציאלי ב-RNA-seqביואינפורמטיקה↔ השוואה
- ניתוח העשרת קבוצות גנים לתאים בודדיםביואינפורמטיקה↔ השוואה