Tests moléculaires et détection du VPH sur des échantillons cytologiques

Les tests moléculaires sur des échantillons cytologiques appliquent des analyses basées sur les acides nucléiques à des cellules obtenues par exfoliation ou aspiration, détectant des cibles d'ADN ou d'ARN qui révèlent une infection, des mutations ou d'autres altérations cliniquement pertinentes. La détection du virus du papillome humain (VPH) à haut risque sur des échantillons de cytologie cervicale en est l'exemple le plus répandu, tandis que le séquençage des ponctions à l'aiguille fine étend le diagnostic moléculaire aux tumeurs solides.

Definition

Les tests moléculaires sur des échantillons cytologiques sont l'application d'analyses basées sur les acides nucléiques – y compris la détection d'acides nucléiques viraux et le profilage des mutations tumorales – à des cellules obtenues par cytologie exfoliative ou par aspiration ou à leur matériel résiduel en milieu liquide.

Scope

Cette entrée couvre l'utilisation de matériel résiduel cytologique et en milieu liquide comme source d'acides nucléiques, la détection du VPH dans le dépistage cervical, et des analyses moléculaires plus larges telles que le séquençage de nouvelle génération sur des aspirats. Il s'agit d'un aperçu méthodologique et de référence qui ne fournit pas de protocoles de dépistage ni de recommandations de traitement.

Core questions

• Quels facteurs pré-analytiques déterminent si le matériel cytologique fournit suffisamment d'acides nucléiques pour les tests ?
• Comment la détection du VPH à haut risque complète-t-elle la cytologie cervicale morphologique dans le dépistage ?
• Quelles analyses moléculaires peuvent être réalisées sur le matériel d'aspiration à l'aiguille fine et le matériel cytologique résiduel ?

Key concepts

• Extraction d'acides nucléiques à partir de matériel cytologique
• Détection du VPH à haut risque
• Cytologie en milieu liquide comme substrat moléculaire
• Stratégies de test réflexe et de co-test
• Séquençage de nouvelle génération sur les aspirats
• Adéquation des échantillons pour les analyses moléculaires

Mechanisms

Les échantillons cytologiques, en particulier les préparations en milieu liquide, retiennent des cellules et du liquide résiduel à partir desquels l'ADN et l'ARN peuvent être extraits ; ces acides nucléiques sont ensuite analysés par des tests d'amplification, d'hybridation ou de séquençage. Dans les applications cervicales, les analyses détectent l'ADN ou l'ARN des types de VPH à haut risque dont l'infection persistante est à la base de la carcinogenèse cervicale, et de tels tests peuvent être combinés à la cytologie morphologique ou s'y substituer. En cytologie des tumeurs solides, le matériel d'aspiration à l'aiguille fine peut fournir suffisamment d'acides nucléiques pour un séquençage ciblé ou de nouvelle génération afin d'identifier des altérations pertinentes pour le diagnostic ou la thérapeutique.

Clinical relevance

Les tests moléculaires transforment un échantillon cytologique en une source d'informations génomiques et virales utilisées pour la classification, la stratification du risque et le rapport de biomarqueurs ; la détection du VPH en particulier a remodelé les paradigmes du dépistage cervical. Cette entrée décrit comment de tels tests sont effectués ; les algorithmes de dépistage spécifiques et les décisions basées sur les biomarqueurs sont des questions cliniques et ne constituent pas ici des conseils individualisés.

Epidemiology

L'infection persistante par les types de VPH à haut risque est la cause nécessaire de presque tous les cancers du col de l'utérus, ce qui fait de la détection de l'acide nucléique viral sur les échantillons de cytologie cervicale une cible de dépistage biologiquement fondée (Schiffman et al., 2007).

Evidence & guidelines

Des preuves de dépistage randomisées, y compris les résultats finaux de l'étude ATHENA, ont évalué le test VPH primaire comme stratégie de dépistage cervical de première ligne par rapport aux approches basées sur la cytologie (Wright et al., 2015). Pour les tumeurs solides, des études ont montré que le séquençage de nouvelle génération peut être réalisé sur des échantillons de cytologie par aspiration à l'aiguille fine pour obtenir des diagnostics moléculaires (Qiu et al., 2015).

History

La découverte que le VPH à haut risque est la cause nécessaire du cancer du col de l'utérus a transformé la cytologie cervicale d'un dépistage purement morphologique en un cadre pour le co-test moléculaire et, plus tard, le dépistage primaire du VPH. Parallèlement, la croissance de la thérapie ciblée contre le cancer a entraîné l'adaptation des analyses moléculaires et de séquençage aux petits échantillons produits par l'aspiration à l'aiguille fine.

Debates

Le test VPH primaire devrait-il remplacer le dépistage cervical basé sur la cytologie ?

Des essais tels qu'ATHENA soutiennent le test VPH primaire comme dépistage de première ligne, mais la combinaison optimale de test VPH, de cytologie et de triage continue de faire l'objet de débats et varie selon les programmes de dépistage.

Seminal works

• schiffman-2007
• wright-2015

Frequently asked questions

Les tests moléculaires peuvent-ils être effectués sur le même échantillon utilisé pour la cytologie ?

Souvent oui ; les préparations de cytologie en milieu liquide retiennent des cellules et du liquide résiduel à partir desquels les acides nucléiques peuvent être extraits, permettant la détection du VPH ou d'autres analyses moléculaires sur le même échantillon.

Pourquoi le test VPH est-il utilisé dans le dépistage du cancer du col de l'utérus ?

L'infection persistante par les types de VPH à haut risque est la cause nécessaire de presque tous les cancers du col de l'utérus, de sorte que la détection de l'acide nucléique viral identifie la population à risque et complète ou, dans certains programmes, précède la cytologie morphologique.