Antibiogramme

Le test de sensibilité aux antimicrobiens (AST) est la mesure en laboratoire de l'inhibition de la croissance d'un micro-organisme par un agent antimicrobien, et à quelle concentration. En exposant un isolat à des concentrations définies de médicament et en interprétant le résultat par rapport à des seuils critiques établis, le laboratoire classe l'organisme comme sensible, intermédiaire (ou sensible-dose-dépendant), ou résistant.

Definition

Le test de sensibilité aux antimicrobiens est la détermination in vitro de l'activité des agents antimicrobiens contre un micro-organisme, généralement exprimée sous forme de concentration minimale inhibitrice et interprétée par rapport à des seuils critiques standardisés comme sensible, intermédiaire ou résistant.

Scope

Cet article aborde les principes des méthodes de dilution et de diffusion, la concentration minimale inhibitrice, les seuils critiques interprétatifs et leurs catégories, la détection des mécanismes de résistance cliniquement importants, et le rôle des données de sensibilité dans la surveillance de la résistance. Il est présenté comme une méthodologie de laboratoire ; il ne fournit pas de choix de médicaments ni de posologies pour un patient donné.

Core questions

• La croissance de cet organisme est-elle inhibée par un agent antimicrobien donné, et à quelle concentration ?
• Comment la concentration minimale inhibitrice est-elle mesurée et interprétée par rapport aux seuils critiques ?
• Quelles méthodes – dilution en bouillon ou sur gélose, diffusion sur disque, bandelettes à gradient, systèmes automatisés – sont utilisées, et quels sont leurs compromis ?
• Comment les mécanismes de résistance spécifiques sont-ils détectés et rapportés, et comment les données de sensibilité alimentent-elles la surveillance ?

Key concepts

• Concentration minimale inhibitrice (CMI)
• Seuils critiques interprétatifs
• Catégories sensible / intermédiaire / résistant
• Méthodes de dilution en bouillon et sur gélose
• Diffusion sur disque et diffusion en gradient
• Systèmes automatisés de test de sensibilité
• Mécanismes de résistance et leur détection
• Surveillance de la résistance aux antimicrobiens

Mechanisms

Le test de sensibilité expose un inoculum standardisé de l'organisme à une gamme de concentrations antimicrobiennes et évalue l'inhibition de la croissance. Les méthodes de dilution déterminent la concentration minimale inhibitrice (CMI), la concentration la plus faible qui empêche la croissance visible ; les méthodes de diffusion lisent une zone d'inhibition de la croissance autour d'un disque imprégné de médicament ou d'une bandelette à gradient et relient sa taille à la sensibilité. Les résultats sont interprétés par rapport à des seuils critiques – des seuils de concentration établis par des organismes de normalisation – pour attribuer les catégories sensible, intermédiaire ou résistant (Jorgensen & Ferraro, 2009). Certains protocoles de travail détectent en outre des déterminants de résistance spécifiques, car la résistance peut apparaître par des mécanismes tels que la modification enzymatique du médicament, l'altération de la cible, l'efflux ou des gènes plasmidiques transférables (Strahilevitz et al., 2009), et les caractéristiques de résistance interagissent de manière complexe avec la virulence et la fitness bactériennes (Beceiro et al., 2013). Des tests de sensibilité plus rapides et plus informatifs font partie de l'objectif plus large d'amélioration des diagnostics des maladies infectieuses (Caliendo et al., 2013).

Clinical relevance

Les résultats de sensibilité sont une contribution essentielle au raisonnement clinique concernant le traitement d'une infection et à la gestion des antimicrobiens (antimicrobial stewardship), mais leur interprétation dépend du site de l'infection, de l'agent pathogène et des facteurs liés au patient. Cet article explique comment la sensibilité est mesurée et catégorisée ; il s'agit d'un matériel de référence et non d'une source de sélection de médicaments ou de recommandations posologiques pour un individu donné.

Epidemiology

Les résultats agrégés de sensibilité constituent une source de données primaire pour la surveillance de la résistance aux antimicrobiens, permettant de suivre comment la résistance émerge et se propage dans les populations et les milieux de soins. La reconnaissance que la résistance peut être portée par des éléments génétiques mobiles (Strahilevitz et al., 2009) et peut co-varier avec la virulence (Beceiro et al., 2013) est à la base de l'attention de la santé publique aux données de résistance en laboratoire.

History

Le test de sensibilité standardisé s'est développé au cours du XXe siècle, passant d'observations ad hoc d'inhibition de la croissance à des méthodes définies de dilution et de diffusion avec des étalons de référence et des seuils critiques interprétatifs. Ces méthodes ont ensuite été complétées par des systèmes automatisés et la détection moléculaire des gènes de résistance. Des revues des principes généraux et des pratiques contemporaines décrivent comment ces méthodes et leurs cadres interprétatifs sont devenus standardisés (Jorgensen & Ferraro, 2009).

Seminal works

• jorgensen-2009
• strahilevitz-2009
• beceiro-2013

Frequently asked questions

Que nous indique une concentration minimale inhibitrice (CMI) ?

La CMI est la concentration la plus faible d'un antimicrobien qui empêche la croissance visible de l'organisme in vitro. Comparée à des seuils critiques standardisés, elle est utilisée pour classer l'organisme comme sensible, intermédiaire ou résistant (Jorgensen & Ferraro, 2009).

Pourquoi existe-t-il différentes méthodes de test de sensibilité ?

Les méthodes de dilution fournissent une CMI numérique, tandis que les méthodes de diffusion (disque ou gradient) déduisent la sensibilité d'une zone d'inhibition ; les systèmes automatisés accélèrent le débit. Les laboratoires choisissent parmi ces méthodes en fonction de l'organisme, des médicaments et de la nécessité d'un résultat numérique par rapport à la rapidité.