Process / pipelineBioinformatics / omics

Polkurikastusanalyysi — Biologinen polkurikastusanalyysi

Polkurikastusanalyysi (PEA) on tilastollinen lähestymistapa, joka ottaa joukon kiinnostavia geenejä tai proteiineja – tyypillisesti johdettuna erotteluanalyysistä tai proteomiikkakokeesta – ja tunnistaa, mitkä ennalta määritellyt biologiset polut tai funktionaaliset geenijoukot edustuvat useammin kuin sattumalta odotettaisiin. Yksittäisten molekyylimuutosten kartoittaminen kuratoituihin polkutietokantoihin, kuten KEGG, Gene Ontology tai Reactome, muuntaa pitkät geenilistat tulkittaviksi biologisiksi prosesseiksi, tehden siitä keskeisen työkalun korkean suorituskyvyn omics-kokeiden jälkianalyysissä.

Avaa sovelluksessa MethodMindTulossaVideoTulossaLataa diat

Lue koko menetelmä

Vain jäsenille

Kirjaudu sisään maksuttomalla tilillä lukeaksesi tämän osion.

Kirjaudu sisään

Menetelmäkartta

Lähimenetelmien naapurusto — valitse solmu tutkiaksesi.

Polkurikastusanalyysi

Geenien joukon rikastumi…Metabolomiikan analyysi Verkostoihin perustuva r…Proteomiikan analyysi RNA-seq-differentiaaliek…Yksittäisen solun RNA-se…Bayesian ChIP-seq peak c…Bayesiläinen eQTL-analyy…Bayesian Gene Set Enrich…Bayesiläinen GWAS

+43 lisää

Lähteet

Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545–15550. DOI: 10.1073/pnas.0506580102 ↗
Alexa, A., Rahnenführer, J., & Lengauer, T. (2006). Improved scoring of functional groups from gene expression data by decorrelating GO graph structure. Bioinformatics, 22(13), 1600–1607. DOI: 10.1093/bioinformatics/btl140 ↗

Näin viittaat tähän sivuun

ScholarGate. (2026, June 3). Biological Pathway Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/fi/bioinformatics/pathway-enrichment-analysis

Mikä menetelmä?

Aseta tämä menetelmä lähimpien sukulaistensa rinnalle ja lue niitä yhdessä — kirjasto asettaa teokset pöydälle; valinta on sinun.

Geenien joukon rikastumisanalyysi (GSEA)Bioinformatiikka↔ vertaa
Metabolomiikan analyysiBioinformatiikka↔ vertaa
Verkostoihin perustuva reitin rikastumisanalyysiBioinformatiikka↔ vertaa
Proteomiikan analyysiBioinformatiikka↔ vertaa
RNA-seq-differentiaaliekspressioanalyysiBioinformatiikka↔ vertaa
Yksittäisen solun RNA-sekvensointi -analyysiBioinformatiikka↔ vertaa

Vertaa rinnakkain →

Tähän viittaavat

Bayesian ChIP-seq peak calling Bayesiläinen eQTL-analyysi Bayesian Gene Set Enrichment Analysis Bayesiläinen GWAS Bayesiläinen metabolomiikka-analyysi Bayesiläinen reitinhakujen rikastumisanalyysi Bayesiläinen proteomiikan analyysi Bayesiläinen RNA-seq-differentiaaliekspressio Differentiaalinen epigenomilaajuinen assosiaatiotutkimus Differentiaalinen eQTL-analyysi Differentiaalinen metabolomiikka-analyysi Differentiaalinen reitinrikastusanalyysi Differentiaalinen proteomiikka-analyysi Epigenomilaajuinen Assosiaatiotutkimus (EWAS)eQTL-analyysi Geenien joukon rikastumisanalyysi (GSEA)Genominlaajuinen assosiaatiotutkimus (GWAS)Koneoppimista hyödyntävä eQTL-analyysi Koneoppimiseen perustuva geenijoukkojen rikastusanalyysi Koneoppimista hyödyntävä mikrobiston monimuotoisuusanalyysi Koneoppimista hyödyntävä RNA-seq-differentiaaliekspressioanalyysi Koneoppimiseen perustuva yksisolun RNA-sekvensointianalyysi Metabolomiikan analyysi Monimuoto-omiikkaan perustuva epigenomilaajuinen assosiaatiotutkimus Multi-omics Gene Set Enrichment Analysis Monitieteinen metabolomiikka-analyysi Monitieteinen mikrobiyhteisön diversiteettianalyysi Moni-omics proteomiikan analyysi Monitieteinen yksisoluisten RNA-seq-analyysi Verkkopohjainen kopiolukuvaihteluanalyysi Verkkopohjainen epigenomilaajuinen assosiaatiotutkimus (Network EWAS)Verkkopohjainen eQTL-analyysi Verkostopohjainen geenijoukon rikastusanalyysi Verkostopohjainen GWAS Verkostopohjainen metabolomiikka-analyysi Verkostoihin perustuva mikrobiyhteisön diversiteettianalyysi Verkostoihin perustuva RNA-seq-differentiaaliekspressioanalyysi Verkostoihin perustuva yksittäissolu-RNA-seq-analyysi Proteomiikan analyysi RNA-seq-differentiaaliekspressioanalyysi Yhden solun eQTL-analyysi Yhden solun geenijoukkojen rikastumisanalyysi Yksisolu-GWAS – Solutyyppispesifi geneettinen assosiaatioanalyysi Yksittäissolujen metabolomiikan analyysi Yksittäisen solun RNA-sekvensointi -analyysi Yksittäisen solun RNA-seq-differentiaalisen ilmentymisen analyysi Aika-sarjojen geenijoukkojen rikastumisanalyysi Aikasarjojen metabolomiikka-analyysi Aikasarjojen mikrobiyhteisön monimuotoisuusanalyysi Ajan sarjan polkujen rikastumisanalyysi Aikasarjojen RNA-seq-differentiaaliekspressio Ajan sarja -yksilusoluisen RNA-seq-analyysin

Huomasitko virheen tällä sivulla? Ilmoita siitä tai ehdota korjausta →