Aikasarjojen mikrobiyhteisön monimuotoisuusanalyysi — Pitkittäisanalyysi mikrobiyhteisön monimuotoisuudesta
Aikasarjojen mikrobiyhteisön monimuotoisuusanalyysi seuraa, kuinka mikrobiyhteisöjen rikkaus, tasaisuus ja koostumus muuttuvat useiden aikapisteiden yli saman koehenkilöryhmän sisällä. Yhdistämällä standardeja monimuotoisuusmittareita pitkittäisiin tilastollisiin malleihin se erottaa todelliset ajalliset dynamiikat yksilöiden välisestä vaihtelusta ja tunnistaa, milloin ja miten häiriöt, kuten ruokavaliomuutokset, antibioottihoito tai sairauden alkaminen, muokkaavat mikrobiyhteisöä.
Lue koko menetelmä
Kirjaudu sisään maksuttomalla tilillä lukeaksesi tämän osion.
Menetelmäkartta
Lähimenetelmien naapurusto — valitse solmu tutkiaksesi.
Lähteet
- Callahan, B. J., McMurdie, P. J., Rosen, M. J., Han, A. W., Johnson, A. J. A., & Holmes, S. P. (2016). DADA2: High-resolution sample inference from Illumina amplicon data. Nature Methods, 13(7), 581–583. DOI: 10.1038/nmeth.3869 ↗
- Chen, Y., Lun, A. T. L., & Smyth, G. K. (2023). Differential abundance testing on single-cell data using quasi-likelihood methods. Genome Biology, 24(1), 188. link ↗
Näin viittaat tähän sivuun
ScholarGate. (2026, June 3). Longitudinal Microbiome Diversity Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/fi/bioinformatics/time-series-microbiome-diversity-analysis
Mikä menetelmä?
Aseta tämä menetelmä lähimpien sukulaistensa rinnalle ja lue niitä yhdessä — kirjasto asettaa teokset pöydälle; valinta on sinun.
- Monitieteinen mikrobiyhteisön diversiteettianalyysiBioinformatiikka↔ vertaa
- PolkurikastusanalyysiBioinformatiikka↔ vertaa
- RNA-seq-differentiaaliekspressioanalyysiBioinformatiikka↔ vertaa
- Yksittäisen solun RNA-sekvensointi -analyysiBioinformatiikka↔ vertaa
- Aikasarjojen RNA-seq-differentiaaliekspressioBioinformatiikka↔ vertaa
Similar methods
Huomasitko virheen tällä sivulla? Ilmoita siitä tai ehdota korjausta →