Verkostopohjainen GWAS — Verkostopohjainen genominlaajuinen assosiaatiotutkimus
Verkostopohjainen GWAS yhdistää perinteisen genominlaajuisen assosiaatiotutkimuksen tulokset biologiseen verkkodataan – kuten proteiini-proteiini-vuorovaikutusverkkoihin (PPI) tai geenien yhteisilmentymisgraafeihin – tunnistaakseen sairauteen liittyviä geenimoduuleja tai aliverkkoja. Sen sijaan, että raportoitaisiin vain yksittäisiä merkittävimpiä SNP:itä, tämä lähestymistapa levittää assosiaatiosignaaleja molekyylien vuorovaikutusverkkojen kautta, tuoden esiin geeniklusterit, joiden kollektiivinen signaali viittaa niiden osallisuuteen kompleksisten ominaisuuksien biologiassa, vaikka yksikään variantti ei yksinään saavuttaisi genominlaajuista merkitsevyyttä.
Lue koko menetelmä
Kirjaudu sisään maksuttomalla tilillä lukeaksesi tämän osion.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Lähteet
- Wang, Q., Yu, H., Zhao, Z., & Jia, P. (2015). EW_dmGWAS: edge-weighted dense module search for genome-wide association studies and gene expression profiles. Bioinformatics, 31(15), 2591–2594. link ↗
- Leiserson, M. D. M., Vandin, F., Wu, H.-T., Dobson, J. R., Eldridge, J. V., Thomas, J. L., Papoutsaki, A., Kim, Y., Niu, B., McLellan, M., Lawrence, M. S., Gonzalez-Perez, A., Tamborero, D., Cheng, Y., Ryslik, G. A., Lopez-Bigas, N., Getz, G., Ding, L., & Raphael, B. J. (2015). Pan-cancer network analysis identifies combinations of rare somatic mutations contributing to tumorigenesis. Nature Genetics, 47(2), 106–114. link ↗
Näin viittaat tähän sivuun
ScholarGate. (2026, June 3). Network-based Genome-Wide Association Study. ScholarGate. https://scholargate.app/fi/bioinformatics/network-based-gwas
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Kopiolukuvaihtelun analyysi – CNV:n havaitseminen ja tulkintaBioinformatiikka↔ compare
- eQTL-analyysiBioinformatiikka↔ compare
- Geenien joukon rikastumisanalyysi (GSEA)Bioinformatiikka↔ compare
- Genominlaajuinen assosiaatiotutkimus (GWAS)Bioinformatiikka↔ compare
- Verkkopohjainen eQTL-analyysiBioinformatiikka↔ compare
- PolkurikastusanalyysiBioinformatiikka↔ compare
Tähän viittaavat
Huomasitko virheen tällä sivulla? Ilmoita siitä tai ehdota korjausta →