ScholarGate
Avustaja
Process / pipelineBioinformatics / omics

Verkostoihin perustuva yksittäissolu-RNA-seq-analyysi

Verkostoihin perustuva yksittäissolu-RNA-seq-analyysi laajentaa standardeja scRNA-seq-työnkulkuja rakentamalla ja tutkimalla molekyylien vuorovaikutusverkostoja — geenisäätelyverkostoja, yhteisgeeniekspressioverkostoja tai solujen välisiä viestintägraafeja — yksittäissolutranskriptomisista tiedoista. Sen sijaan, että kutakin geeniä käsiteltäisiin itsenäisesti, tämä lähestymistapa vangitsee geenipiirien ja solujen välisten signalointireittien koordinoidun toiminnan solupopulaatioiden sisällä ja välillä, mahdollistaen systeemisen tason näkymän transkriptionaaliseen säätelyyn yksittäissoluresoluutiolla.

Avaa sovelluksessa MethodMindTulossaVideoTulossaLataa diat

Lue koko menetelmä

Vain jäsenille

Kirjaudu sisään maksuttomalla tilillä lukeaksesi tämän osion.

Kirjaudu sisään

Menetelmäkartta

Lähimenetelmien naapurusto — valitse solmu tutkiaksesi.

Lähteet

  1. Aibar, S., González-Blas, C. B., Moerman, T., Huynh-Thu, V. A., Imrichova, H., Hulselmans, G., ... & Aerts, S. (2017). SCENIC: single-cell regulatory network inference and clustering. Nature Methods, 14(11), 1083–1086. link
  2. Jin, S., Guerrero-Juarez, C. F., Zhang, L., Chang, I., Ramos, R., Kuan, C. H., ... & Nie, Q. (2021). Inference and analysis of cell-cell communication using CellChat. Nature Communications, 12(1), 1088. link

Näin viittaat tähän sivuun

ScholarGate. (2026, June 3). Network-based Single-Cell RNA Sequencing Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/fi/bioinformatics/network-based-single-cell-rna-seq-analysis

Mikä menetelmä?

Aseta tämä menetelmä lähimpien sukulaistensa rinnalle ja lue niitä yhdessä — kirjasto asettaa teokset pöydälle; valinta on sinun.

Vertaa rinnakkain
ScholarGateNetwork-based single-cell RNA-seq analysis (Network-based Single-Cell RNA Sequencing Analysis). Haettu 2026-06-15 osoitteesta https://scholargate.app/fi/bioinformatics/network-based-single-cell-rna-seq-analysis · Aineisto: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026