Process / pipelineBioinformatics / omics

Geenien joukon rikastumisanalyysi (GSEA)

Geenien joukon rikastumisanalyysi (GSEA) on laskennallinen menetelmä, jolla määritetään, osoittaako ennalta määritelty geenijoukko – joka edustaa biologista reittiä, prosessia tai toimintoa – tilastollisesti merkitseviä, koordinoituja eroja kahden biologisen tilan välillä. Toisin kuin yksinkertainen taitto-muutos-suodatus, GSEA toimii kaikilla mitatuilla geeneillä, jotka on järjestetty korrelaatiometriikan mukaan, havaiten hienovaraisia mutta johdonmukaisia siirtymiä koko reitin alueella, vaikka yksikään geeni ei saavuttaisi merkitsevyyskynnystä.

Avaa sovelluksessa MethodMindTulossaApply, compare, get guidance

Tools & resources

Lataa diat

Learn & explore

VideoTulossa

Lue koko menetelmä

Vain jäsenille

Kirjaudu sisään maksuttomalla tilillä lukeaksesi tämän osion.

Kirjaudu sisään

Menetelmäkartta

Lähimenetelmien naapurusto — valitse solmu tutkiaksesi.

Geenien joukon rikastumisanalyysi (GSEA)

Multi-omics Gene Set Enr…Verkostopohjainen geenij…Polkurikastusanalyysi RNA-seq-differentiaaliek…Yksittäisen solun RNA-se…Bayesian Gene Set Enrich…Bayesiläinen mikrobiyhte…Bayesiläinen reitinhakuj…Bayesiläinen RNA-seq-dif…Differentiaalinen ChIP-s…

+27 lisää

Lähteet

Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545–15550. DOI: 10.1073/pnas.0506580102 ↗
Mootha, V. K., Lindgren, C. M., Eriksson, K. F., Subramanian, A., Sihag, S., Lehar, J., Puigserver, P., Carlsson, E., Ridderstrale, M., Laurila, E., Houstis, N., Daly, M. J., Patterson, N., Mesirov, J. P., Golub, T. R., Tamayo, P., Spiegelman, B., Lander, E. S., Hirschhorn, J. N., Altshuler, D., & Groop, L. C. (2003). PGC-1alpha-responsive genes involved in oxidative phosphorylation are coordinately downregulated in human diabetes. Nature Genetics, 34(3), 267–273. DOI: 10.1038/ng1180 ↗

Näin viittaat tähän sivuun

ScholarGate. (2026, June 3). Gene Set Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/fi/bioinformatics/gene-set-enrichment-analysis

Mikä menetelmä?

Aseta tämä menetelmä lähimpien sukulaistensa rinnalle ja lue niitä yhdessä — kirjasto asettaa teokset pöydälle; valinta on sinun.

Multi-omics Gene Set Enrichment AnalysisBioinformatiikka↔ vertaa
Verkostopohjainen geenijoukon rikastusanalyysiBioinformatiikka↔ vertaa
PolkurikastusanalyysiBioinformatiikka↔ vertaa
RNA-seq-differentiaaliekspressioanalyysiBioinformatiikka↔ vertaa
Yksittäisen solun RNA-sekvensointi -analyysiBioinformatiikka↔ vertaa

Vertaa rinnakkain →

Tähän viittaavat

Bayesian Gene Set Enrichment Analysis Bayesiläinen mikrobiyhteisön monimuotoisuusanalyysi Bayesiläinen reitinhakujen rikastumisanalyysi Bayesiläinen RNA-seq-differentiaaliekspressio Differentiaalinen ChIP-seq-piikkien tunnistus Differentiaalinen reitinrikastusanalyysi eQTL-analyysi Koneoppimiseen perustuva geenijoukkojen rikastusanalyysi Koneoppimista hyödyntävä reittien rikastumisanalyysi Koneoppimista hyödyntävä RNA-seq-differentiaaliekspressioanalyysi Koneoppimiseen perustuva yksisolun RNA-sekvensointianalyysi Metabolomiikan analyysi Multi-omics Gene Set Enrichment Analysis Monitieteinen metabolomiikka-analyysi Monitieteinen mikrobiyhteisön diversiteettianalyysi Moni-omics polkurikastusanalyysi Moni-omics proteomiikan analyysi Moni-omics RNA-seq-differentiaaliekspressioanalyysi Monitieteinen yksisoluisten RNA-seq-analyysi Verkkopohjainen kopiolukuvaihteluanalyysi Verkostopohjainen geenijoukon rikastusanalyysi Verkostopohjainen GWAS Verkostopohjainen metabolomiikka-analyysi Verkostoihin perustuva mikrobiyhteisön diversiteettianalyysi Verkostoihin perustuva reitin rikastumisanalyysi Verkostoihin perustuva RNA-seq-differentiaaliekspressioanalyysi Verkostoihin perustuva yksittäissolu-RNA-seq-analyysi Polkurikastusanalyysi Proteomiikan analyysi RNA-seq-differentiaaliekspressioanalyysi Yhden solun geenijoukkojen rikastumisanalyysi Yksittäisen solun RNA-sekvensointi -analyysi Yksittäisen solun RNA-seq-differentiaalisen ilmentymisen analyysi Aika-sarjojen geenijoukkojen rikastumisanalyysi Ajan sarjan polkujen rikastumisanalyysi Aikasarjojen RNA-seq-differentiaaliekspressio Ajan sarja -yksilusoluisen RNA-seq-analyysin

Related reference concepts

Pathway Enrichment and Network Analysis Functional Genomics and Pathway Analysis Gene Ontology and Biological Databases Gene Expression Signatures and Prognostic Markers Transcriptomics and Gene Expression Analysis Systems Genomics and Network Biology

Huomasitko virheen tällä sivulla? Ilmoita siitä tai ehdota korjausta →