Monitieteinen mikrobiyhteisön diversiteettianalyysi
Monitieteinen mikrobiyhteisön diversiteettianalyysi integroi kaksi tai useampia omisia datakerroksia – kuten metagenomiikkaa, metatranskriptomiikkaa, metabolomiikkaa ja metaproteomiikkaa – karakterisoidakseen mikrobiyhteisöjen koostumusta ja toiminnallista aktiivisuutta. Yhdistämällä taksonomisia diversiteettimittoja molekyylifenotyyppidataan, lähestymistapa paljastaa, miten yhteisön rakenne muuntuu ekologisiksi ja isäntään liittyviksi toiminnoiksi, joita yksikään omiskerros ei voi yksinään paljastaa.
Lue koko menetelmä
Kirjaudu sisään maksuttomalla tilillä lukeaksesi tämän osion.
Menetelmäkartta
Lähimenetelmien naapurusto — valitse solmu tutkiaksesi.
Lähteet
- Rohart, F., Gautier, B., Singh, A., & Le Cao, K.-A. (2017). mixOmics: An R package for 'omics feature selection and multiple data integration. PLOS Computational Biology, 13(11), e1005752. DOI: 10.1371/journal.pcbi.1005752 ↗
- Argelaguet, R., Velten, B., Arnol, D., Dietrich, S., Zenz, T., Marioni, J. C., Buettner, F., Huber, W., & Stegle, O. (2018). Multi-Omics Factor Analysis — a framework for unsupervised integration of multi-omics data sets. Molecular Systems Biology, 14(6), e8124. DOI: 10.15252/msb.20178124 ↗
Näin viittaat tähän sivuun
ScholarGate. (2026, June 3). Multi-omics Microbiome Diversity Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/fi/bioinformatics/multi-omics-microbiome-diversity-analysis
Mikä menetelmä?
Aseta tämä menetelmä lähimpien sukulaistensa rinnalle ja lue niitä yhdessä — kirjasto asettaa teokset pöydälle; valinta on sinun.
- Geenien joukon rikastumisanalyysi (GSEA)Bioinformatiikka↔ vertaa
- Metabolomiikan analyysiBioinformatiikka↔ vertaa
- Monitieteinen metabolomiikka-analyysiBioinformatiikka↔ vertaa
- Verkostoihin perustuva mikrobiyhteisön diversiteettianalyysiBioinformatiikka↔ vertaa
- PolkurikastusanalyysiBioinformatiikka↔ vertaa
Tähän viittaavat
Huomasitko virheen tällä sivulla? Ilmoita siitä tai ehdota korjausta →