Мрежово базиран GWAS — Мрежово базиран анализ на асоциации в целия геном
Мрежово базираният GWAS интегрира резултати от конвенционален анализ на асоциации в целия геном с данни от биологични мрежи — като мрежи за взаимодействия протеин-протеин (PPI) или графи на съвместна експресия на гени — за идентифициране на свързани с болестта генни модули или подмрежи. Вместо да докладва само най-значимите индивидуални SNP, този подход разпространява сигналите за асоциация през мрежите на молекулярните взаимодействия, като извежда генни клъстери, чийто колективен сигнал ги свързва с биологията на сложните признаци, дори когато нито един вариант сам по себе си не достига значимост в мащаба на целия геном.
Прочетете целия метод
Влезте с безплатен профил, за да прочетете този раздел.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Източници
- Wang, Q., Yu, H., Zhao, Z., & Jia, P. (2015). EW_dmGWAS: edge-weighted dense module search for genome-wide association studies and gene expression profiles. Bioinformatics, 31(15), 2591–2594. link ↗
- Leiserson, M. D. M., Vandin, F., Wu, H.-T., Dobson, J. R., Eldridge, J. V., Thomas, J. L., Papoutsaki, A., Kim, Y., Niu, B., McLellan, M., Lawrence, M. S., Gonzalez-Perez, A., Tamborero, D., Cheng, Y., Ryslik, G. A., Lopez-Bigas, N., Getz, G., Ding, L., & Raphael, B. J. (2015). Pan-cancer network analysis identifies combinations of rare somatic mutations contributing to tumorigenesis. Nature Genetics, 47(2), 106–114. link ↗
Как да цитирате тази страница
ScholarGate. (2026, June 3). Network-based Genome-Wide Association Study. ScholarGate. https://scholargate.app/bg/bioinformatics/network-based-gwas
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Анализ на вариациите в броя на копиятаБиоинформатика↔ compare
- eQTL анализБиоинформатика↔ compare
- Анализ на обогатяване на генни набори (GSEA)Биоинформатика↔ compare
- Геномно-широко асоциативно изследване (GWAS)Биоинформатика↔ compare
- Мрежово базиран анализ на eQTLБиоинформатика↔ compare
- Анализ на обогатяване на пътищаБиоинформатика↔ compare
Цитиран в
Забелязахте ли проблем на тази страница? Съобщете или предложете поправка →