Анализ на вариациите в броя на копията, базиран на мрежи
Анализът на вариациите в броя на копията (ВБК), базиран на мрежи, интегрира геномни данни за ВБК с биологични мрежи за взаимодействие — като мрежи за протеин-протеинни взаимодействия (PPI) или сигнални пътища — за идентифициране на функционално кохерентни региони, драйверни гени и променени подмрежи, които само по себе си извличане на сурови ВБК би пропуснало. Чрез разпространение на сигналите за ВБК през графа на мрежата, методът разкрива координирани неравновесия в дозировката на генома, които се събират около общи биологични функции, което го прави особено мощен в геномиката на рака и изследванията на редки заболявания.
Прочетете целия метод
Влезте с безплатен профил, за да прочетете този раздел.
Карта на методите
Обкръжението на сродните методи — изберете възел, за да го разгледате.
Източници
- Vandin, F., Upfal, E., & Raphael, B. J. (2012). De novo discovery of mutated driver pathways in cancer. Genome Research, 22(2), 375–385. DOI: 10.1101/gr.120477.111 ↗
- Leiserson, M. D. M., Vandin, F., Wu, H.-T., Dobson, J. R., Eldridge, J. V., Thomas, J. L., Papoutsaki, A., Kim, Y., Niu, B., McLellan, M., Lawrence, M. S., Gonzalez-Perez, A., Tamborero, D., Cheng, Y., Ryslik, G. A., Lopez-Bigas, N., Getz, G., Ding, L., & Raphael, B. J. (2015). Pan-cancer network analysis identifies combinations of rare somatic mutations across pathways and protein complexes. Nature Genetics, 47(2), 106–114. DOI: 10.1038/ng.3168 ↗
Как да цитирате тази страница
ScholarGate. (2026, June 3). Network-Based Copy Number Variation Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/bg/bioinformatics/network-based-copy-number-variation-analysis
Кой метод?
Поставете този метод до най-близките му сродни методи и ги четете едно до друго — библиотеката полага книгите на масата; изборът е ваш.
- Анализ на вариациите в броя на копиятаБиоинформатика↔ сравняване
- Анализ на обогатяване на генни набори (GSEA)Биоинформатика↔ сравняване
- Мрежово базиран GWASБиоинформатика↔ сравняване
- Мрежов анализ на диференциалната експресия на РНК-секвенцияБиоинформатика↔ сравняване
- Анализ на обогатяване на пътищаБиоинформатика↔ сравняване
- Вариантно призоваванеБиоинформатика↔ сравняване
Забелязахте ли проблем на тази страница? Съобщете или предложете поправка →