Мрежово обогатяване на пътища
Мрежовото обогатяване на пътища интегрира мрежи от молекулни взаимодействия — протеин-протеинни взаимодействия, сигнални графи или генно-регулаторни мрежи — с омиксни измервания за идентифициране на биологични пътища, които са координирано променени при дадено състояние. За разлика от класическите подходи за свръхпредставяне или обогатяване на генни набори, които третират гените от пътя като независими списъци, това семейство методи разпространява сигнали по краищата на мрежата, улавяйки топологията на взаимодействията и разкривайки нарушени модули, които обогатяването чрез плоски списъци би пропуснало.
Прочетете целия метод
Влезте с безплатен профил, за да прочетете този раздел.
Карта на методите
Обкръжението на сродните методи — изберете възел, за да го разгледате.
Източници
- Ideker, T., Ozier, O., Schwikowski, B., & Siegel, A. F. (2002). Discovering regulatory and signalling circuits in molecular interaction networks. Bioinformatics, 18(suppl_1), S233–S240. link ↗
- Vaske, C. J., Benz, S. C., Sanborn, J. Z., Earl, D., Szeto, C., Zhu, J., Haussler, D., & Stuart, J. M. (2010). Inference of patient-specific pathway activities from multi-dimensional cancer genomics data using PARADIGM. Bioinformatics, 26(12), i237–i245. DOI: 10.1093/bioinformatics/btq182 ↗
Как да цитирате тази страница
ScholarGate. (2026, June 3). Network-based Pathway Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/bg/bioinformatics/network-based-pathway-enrichment-analysis
Кой метод?
Поставете този метод до най-близките му сродни методи и ги четете едно до друго — библиотеката полага книгите на масата; изборът е ваш.
- Анализ на обогатяване на генни набори (GSEA)Биоинформатика↔ сравняване
Цитиран в
Забелязахте ли проблем на тази страница? Съобщете или предложете поправка →