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分子诊断方法与技术

分子诊断方法在核酸和其他分子层面检测和表征疾病,而非仅通过细胞或组织形态学。本领域旨在向读者介绍分子病理学的主要实验室技术——扩增、测序、杂交、定量分析以及循环生物标志物采样——以及每种技术如何将生物样本转化为分子读数。

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Definition

分子诊断技术是识别、扩增、测序、定量或定位特定核酸序列(及相关分子)以表征疾病分子基础的实验室方法。

Scope

本领域概述了分子病理学中使用的技术,并将其分为五个主题:核酸扩增、DNA和RNA测序、细胞遗传学和FISH方法、实时定量和拷贝数分析以及液体活检。这些内容被视为方法学参考资料,而非操作规程或临床指南。

Sub-topics

Key concepts

  • 核酸扩增
  • DNA和RNA测序
  • 杂交和原位检测
  • 定量和拷贝数分析
  • 循环生物标志物和液体活检
  • 分析灵敏度和特异性

Mechanisms

在本领域中,各种方法通常遵循一个共同的流程:捕获或提取目标核酸,然后进行选择性扩增、杂交、测序或定量,以产生可测量的信号。扩增技术(如聚合酶链反应)使稀有序列可被检测(Saiki et al., 1985);测序通过链终止法(Sanger et al., 1977)或大规模并行平台(Goodwin et al., 2016)读取碱基顺序;基于杂交的方法定位细胞或染色体内的序列;定量方法则估计目标物的含量。液体活检将这些工具扩展到血液和其他体液中脱落的核酸(Wan et al., 2017)。

Clinical relevance

分子诊断技术是当代诊断病理学的基础,从病原体检测到肿瘤表征。本条目描述这些技术作为一个参考框架,以理解分子结果是如何产生的;它并非指导在患者护理中订购、解释或执行任何特定检测的指南。

Evidence & guidelines

本领域的方法得到了大量原始文献和综述文献的支持,涵盖了PCR和Sanger测序的基础描述,直至现代下一代测序和循环肿瘤DNA综述(Saiki et al., 1985; Sanger et al., 1977; Goodwin et al., 2016; Wan et al., 2017)。详细的报告标准和共识建议在各个主题条目中讨论。

History

分子诊断学起源于20世纪70年代重组DNA技术的融合、Sanger的链终止测序(1977年)以及20世纪80年代中期PCR的发明(Saiki et al., 1985)。随后的几十年里,又增加了实时定量PCR、荧光原位杂交、微阵列和高通量测序,将该领域从单基因检测扩展到基因组规模分析(Goodwin et al., 2016),最近又扩展到微创液体活检(Wan et al., 2017)。

Key figures

  • Kary Mullis
  • Frederick Sanger
  • Russell Higuchi

Related topics

Seminal works

  • saiki-1985
  • sanger-1977
  • goodwin-2016

Frequently asked questions

分子诊断学与传统病理学有何区别?
传统病理学主要依赖细胞和组织的形态学表现,而分子诊断学直接检测和表征特定的核酸序列和分子改变,通常能揭示显微镜下不可见的改变。
分子诊断技术的主要类别有哪些?
它们包括核酸扩增、DNA和RNA测序、细胞遗传学和原位杂交方法、实时定量和拷贝数分析,以及通过液体活检对循环生物标志物进行分析。

Methods for this concept

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