真菌鉴定和抗真菌药物敏感性测试
真菌鉴定和抗真菌药物敏感性测试是检测和命名引起人类感染的酵母菌和霉菌,并测量它们对抗真菌药物敏感性的实验室方法。诊断性真菌学结合了显微镜检查和培养,以及抗原和抗体检测、分子方法和蛋白质组学鉴定,并增加了抗真菌药物的体外敏感性测试。
Definition
真菌鉴定是通过显微镜、培养、血清学、分子或蛋白质组学方法,从临床样本中确定酵母菌或霉菌种类的实验室过程;抗真菌药物敏感性测试是体外测量真菌分离株对抗真菌药物敏感性的过程。
Scope
本条目涵盖了直接显微镜检查和培养、抗原和抗体(血清学)检测、真菌的核酸和蛋白质组学鉴定,以及具有解释性断点的抗真菌药物敏感性测试。它将这些作为实验室方法进行讨论,不提供患者的抗真菌药物选择或剂量。
Core questions
- 此样本中是否存在真菌,它是什么物种?
- 哪种方法——显微镜检查、培养、抗原或抗体检测、分子检测或质谱法——最能有效地检测和鉴定它?
- 该分离株是否对相关抗真菌药物敏感,如何测量和解释?
- 真菌诊断在敏感性、速度和标准化方面的局限性是什么?
Key concepts
- 直接显微镜检查(KOH、荧光增白剂、组织病理学)
- 真菌培养和形态学
- 抗原检测(例如,半乳甘露聚糖、新型隐球菌抗原、β-D-葡聚糖)
- 抗体(血清学)测试
- 分子和蛋白质组学鉴定
- 真菌的MALDI-TOF质谱法
- 抗真菌药物敏感性测试和断点
- 酵母菌与霉菌
Mechanisms
诊断性真菌学通过染色和显微镜观察样本中的真菌、通过培养并读取菌落和微观形态,以及通过非培养方法来检测真菌。抗原检测法检测循环中的真菌细胞壁或荚膜成分,而抗体检测法检测宿主反应;这些方法与分子检测和蛋白质组学鉴定一起,将检测范围扩展到生长缓慢或难以培养的生物(Kozel & Wickes, 2014)。物种水平的鉴定越来越多地使用MALDI-TOF质谱法,该方法将真菌分离株的蛋白质谱与参考数据库进行匹配(Clark et al., 2013)。抗真菌药物敏感性测试随后测量抗真菌药物对分离株的抑制活性,并根据断点进行解释;标准化此测试并将其与结果关联起来一直是一项不断发展的努力(Rex & Pfaller, 2002)。专业指南将这些实验室方法置于真菌病的更广泛诊断评估中(Pappas et al., 2016)。
Clinical relevance
真菌鉴定和敏感性结果有助于对侵袭性和浅表真菌感染的临床推理,并为抗真菌药物的管理提供信息。本条目描述了这些实验室结果是如何产生和解释的;它是参考材料,不能作为个体选择或剂量抗真菌治疗的基础,这由临床指南和治疗团队解决。
Epidemiology
诊断性真菌学支持对真菌病原体和新兴抗真菌耐药性的监测,包括引起念珠菌病等感染的物种变化。指南文件反映了实验室诊断和敏感性数据如何为群体和个体层面的管理提供信息(Pappas et al., 2016)。
History
真菌学诊断长期依赖于显微镜检查和形态学鉴定的缓慢培养。抗原和抗体检测,以及后来的分子和蛋白质组学方法,拓宽并加速了检测(Kozel & Wickes, 2014),而抗真菌药物敏感性测试在20世纪末和21世纪初从研究工具发展成为标准化的临床检测(Rex & Pfaller, 2002)。
Related topics
Seminal works
- kozel-2014
- rex-2002
- pappas-2016
Frequently asked questions
- 当培养缓慢或阴性时,如何检测真菌?
- 实验室使用非培养方法——抗原检测(如新型隐球菌抗原、半乳甘露聚糖或β-D-葡聚糖)、抗体检测和分子检测——来检测生长缓慢或无法从特定样本中培养的真菌(Kozel & Wickes, 2014)。
- 什么是抗真菌药物敏感性测试?
- 它是体外测量抗真菌药物是否抑制真菌分离株,并根据断点进行解释。标准化此测试并将其与临床结果关联起来一直是一个渐进的过程(Rex & Pfaller, 2002)。