การเก็บตัวอย่างและการยืนยันทางห้องปฏิบัติการ

การยืนยันทางห้องปฏิบัติการเป็นหัวใจสำคัญของการสอบสวนการระบาด โดยการระบุเชื้อก่อโรคและยืนยันว่าผู้ป่วยรายใดติดเชื้อจริง กระบวนการนี้เริ่มต้นด้วยการเก็บตัวอย่างทางคลินิกหรือสิ่งแวดล้อมที่เหมาะสม ในเวลาที่เหมาะสม จากบุคคลที่เหมาะสม และดำเนินต่อไปจนถึงการขนส่ง การทดสอบ และการจำแนกชนิดในห้องปฏิบัติการ ซึ่งท้ายที่สุดจะแยกแยะผู้ป่วยที่ได้รับการยืนยันออกจากผู้ที่เพียงแค่มีอาการตามคำจำกัดความทางคลินิก

Definition

การเก็บตัวอย่างและการยืนยันทางห้องปฏิบัติการ คือการเก็บ การขนส่ง และการทดสอบตัวอย่างทางคลินิกหรือสิ่งแวดล้อม เพื่อระบุและจำแนกลักษณะของเชื้อก่อโรคในการระบาด ทำให้สามารถยืนยันการวินิจฉัย การจำแนกประเภทผู้ป่วย และการเชื่อมโยงทางห้องปฏิบัติการระหว่างผู้ป่วยได้

Scope

หัวข้อนี้ครอบคลุมถึงเหตุผลและวิธีการเก็บตัวอย่างระหว่างการสอบสวน บทบาทของห้องปฏิบัติการในการยืนยันการวินิจฉัยและปรับปรุงคำจำกัดความผู้ป่วยให้เป็นระดับยืนยัน น่าจะเป็น และสงสัย รวมถึงการใช้การจำแนกชนิดทางห้องปฏิบัติการและการจัดลำดับจีโนมเพื่อเชื่อมโยงผู้ป่วยเข้าด้วยกัน เนื้อหานี้เป็นแนวคิดและระเบียบวิธีวิจัย ไม่ได้ให้ระเบียบปฏิบัติในการจัดการตัวอย่าง เกณฑ์การทดสอบ หรือขั้นตอนความปลอดภัยทางชีวภาพสำหรับเชื้อก่อโรคใดๆ ซึ่งอยู่ภายใต้การกำกับดูแลของห้องปฏิบัติการและแนวทางสาธารณสุข

Core questions

• ตัวอย่างใด จากใคร และ ณ จุดใดของอาการป่วยที่จะระบุเชื้อก่อโรคได้ดีที่สุด?
• ตัวอย่างถูกเก็บ ขนส่ง และทดสอบอย่างไรเพื่อให้ได้ผลลัพธ์ที่ถูกต้อง?
• การยืนยันทางห้องปฏิบัติการกำหนดประเภทผู้ป่วยที่ได้รับการยืนยัน น่าจะเป็น และสงสัยได้อย่างไร?
• การจำแนกชนิดทางห้องปฏิบัติการหรือการจัดลำดับจีโนมสามารถเชื่อมโยงผู้ป่วยเข้าด้วยกันและไปยังแหล่งที่มาได้อย่างไร?

Key concepts

• ตัวอย่างทางคลินิกและสิ่งแวดล้อม
• ช่วงเวลาในการเก็บตัวอย่างที่สัมพันธ์กับอาการป่วย
• การขนส่งตัวอย่างและห่วงโซ่การดูแล
• ประเภทผู้ป่วยที่ได้รับการยืนยัน น่าจะเป็น และสงสัย
• ความไวและความจำเพาะของการทดสอบวินิจฉัย
• การจำแนกชนิดและการจำแนกชนิดย่อยทางห้องปฏิบัติการ
• การจัดลำดับจีโนมทั้งหมดเพื่อเชื่อมโยงผู้ป่วย

Mechanisms

ตัวอย่างที่เหมาะสม เช่น ตัวอย่างจากระบบทางเดินหายใจ อุจจาระ เลือด หรืออาหารและน้ำที่เกี่ยวข้อง จะถูกเก็บจากผู้ป่วยจำนวนเพียงพอ โดยเฉพาะอย่างยิ่งก่อนการรักษาจะเปลี่ยนแปลงผลลัพธ์ และขนส่งภายใต้สภาวะที่รักษาเชื้อก่อโรคไว้ได้ พร้อมบันทึกการจัดการอย่างละเอียด จากนั้นห้องปฏิบัติการจะตรวจหาและระบุเชื้อก่อโรค และผลลัพธ์เหล่านี้จะช่วยให้คำจำกัดความผู้ป่วยมีความชัดเจนขึ้นเป็นระดับต่างๆ: ผู้ป่วยที่ได้รับการยืนยันจะต้องเข้าเกณฑ์ทางห้องปฏิบัติการ ในขณะที่ผู้ป่วยที่น่าจะเป็นและผู้ป่วยที่สงสัยจะขึ้นอยู่กับลักษณะทางคลินิกหรือระบาดวิทยา การจำแนกชนิดย่อยและการจัดลำดับจีโนมทั้งหมดจะช่วยยืนยันเพิ่มเติมว่าผู้ป่วยมีเชื้อสายพันธุ์เดียวกันหรือไม่ ซึ่งสนับสนุนหรือหักล้างความเชื่อมโยงทางระบาดวิทยา และช่วยเชื่อมโยงผู้ป่วยไปยังแหล่งที่มาเดียวกัน คุณค่าในการตีความผลลัพธ์ใดๆ ขึ้นอยู่กับความไวและความจำเพาะของการทดสอบ

Clinical relevance

แพทย์และเจ้าหน้าที่ห้องปฏิบัติการเป็นผู้เก็บตัวอย่างและสร้างผลลัพธ์ที่ยืนยันเชื้อก่อโรคของการระบาดและจำแนกประเภทผู้ป่วย ดังนั้นคุณภาพและเวลาในการเก็บตัวอย่างจึงส่งผลโดยตรงต่อการสอบสวน การทำความเข้าใจการยืนยันทางห้องปฏิบัติการช่วยให้ผู้เชี่ยวชาญด้านสุขภาพตีความได้ว่าเหตุใดผู้ป่วยจึงถูกจัดประเภทเป็นผู้ป่วยที่ได้รับการยืนยันแทนที่จะเป็นผู้ป่วยที่สงสัย บทความนี้อธิบายบทบาทของการยืนยันทางห้องปฏิบัติการในการสอบสวน และไม่ใช่ระเบียบปฏิบัติในการจัดการตัวอย่าง ความปลอดภัยทางชีวภาพ หรือการวินิจฉัยสำหรับเชื้อก่อโรคเฉพาะใดๆ

Epidemiology

การยืนยันทางห้องปฏิบัติการเป็นหัวใจสำคัญในการรับรู้ว่า SARS เป็นโรคใหม่ที่แตกต่างในปี 2003 โดยการจำแนกลักษณะทางคลินิกและห้องปฏิบัติการได้กำหนดกลุ่มอาการและผู้ป่วยของโรคนี้ โดยทั่วไปแล้ว การบูรณาการการจัดลำดับจีโนมของเชื้อก่อโรคเข้ากับข้อมูลระบาดวิทยาได้กลายเป็นวิธีมาตรฐานในการยืนยันเชื้อก่อโรคและเชื่อมโยงผู้ป่วยในการสอบสวนการระบาด ซึ่งช่วยเสริมสร้างทั้งการจำแนกประเภทผู้ป่วยและการระบุแหล่งที่มา

History

แบคทีเรียวิทยาในช่วงปลายศตวรรษที่ 19 เป็นครั้งแรกที่ทำให้สามารถเชื่อมโยงการระบาดเข้ากับสิ่งมีชีวิตที่ระบุได้ และระบาดวิทยาภาคสนามในศตวรรษที่ 20 ได้ผนวกการยืนยันทางห้องปฏิบัติการเข้ากับคำจำกัดความผู้ป่วยแบบแบ่งระดับ ได้แก่ ผู้ป่วยที่ได้รับการยืนยัน ผู้ป่วยที่น่าจะเป็น และผู้ป่วยที่สงสัย การจำแนกชนิดย่อยระดับโมเลกุล และล่าสุดคือการจัดลำดับจีโนมทั้งหมด ได้ขยายบทบาทของห้องปฏิบัติการจากการระบุเชื้อก่อโรคไปสู่การระบุว่าผู้ป่วยรายใดมีความเชื่อมโยงกัน โดยบูรณาการหลักฐานทางห้องปฏิบัติการและระบาดวิทยาเข้าด้วยกัน

Debates

คำจำกัดความผู้ป่วยควรสร้างสมดุลระหว่างการยืนยันทางห้องปฏิบัติการกับความไวอย่างไร?

การกำหนดให้มีการยืนยันทางห้องปฏิบัติการจะเพิ่มความจำเพาะ แต่อาจพลาดผู้ป่วยจริงที่ไม่มีผลการทดสอบเป็นบวก ในขณะที่คำจำกัดความทางคลินิกที่กว้างจะครอบคลุมผู้ป่วยได้มากขึ้นโดยมีค่าใช้จ่ายในการรวมผู้ที่ไม่ใช่ผู้ป่วย การสอบสวนจึงใช้คำจำกัดความแบบแบ่งระดับและปรับเปลี่ยนตามความสามารถในการทดสอบและความต้องการของการสอบสวนที่เปลี่ยนแปลงไป

Key figures

• Michael Gregg
• Yonatan Grad
• Marc Lipsitch

Seminal works

• lee-2003
• grad-lipsitch-2014

Frequently asked questions

เหตุใดผู้ป่วยจึงถูกจัดประเภทเป็นผู้ป่วยที่ได้รับการยืนยัน น่าจะเป็น หรือสงสัย?

คำจำกัดความผู้ป่วยแบบแบ่งระดับช่วยให้การสอบสวนสามารถสร้างสมดุลระหว่างความถูกต้องและความสมบูรณ์: ผู้ป่วยที่ได้รับการยืนยันจะต้องเข้าเกณฑ์ทางห้องปฏิบัติการและมีความจำเพาะมากที่สุด ในขณะที่ประเภทที่น่าจะเป็นและสงสัยจะครอบคลุมผู้ป่วยที่มีอาการเข้ากันได้ทางคลินิกหรือระบาดวิทยาแต่ขาดการยืนยันทางห้องปฏิบัติการ เพื่อไม่ให้พลาดผู้ป่วยจริงในช่วงแรก

การจัดลำดับจีโนมช่วยยืนยันการระบาดได้อย่างไร?

นอกเหนือจากการระบุเชื้อก่อโรคแล้ว การจัดลำดับจีโนมยังเปรียบเทียบจีโนมของเชื้อที่แยกได้จากผู้ป่วยที่แตกต่างกัน ลำดับที่ใกล้เคียงกันจะสนับสนุนข้อสรุปว่าผู้ป่วยเป็นส่วนหนึ่งของการระบาดเดียวกันและอาจมีแหล่งที่มาเดียวกัน ซึ่งช่วยเสริมหลักฐานทางระบาดวิทยา