อคติจากการเป็นตัวแทนในการวิจัยเภสัชพันธุศาสตร์

อคติจากการเป็นตัวแทนคือการที่ประชากรบางกลุ่ม โดยเฉพาะอย่างยิ่งผู้ที่มีเชื้อสายยุโรป มีจำนวนมากเกินไปอย่างเป็นระบบ และประชากรกลุ่มอื่นมีจำนวนน้อยเกินไปในกลุ่มตัวอย่าง ฐานข้อมูลอ้างอิง และการศึกษาเพื่อตรวจสอบความถูกต้องซึ่งเป็นรากฐานของเภสัชพันธุศาสตร์ เนื่องจากการค้นพบและการระบุเภสัชพันธุกรรมนั้นปรับเทียบตามประชากรที่ศึกษา ความไม่สมดุลนี้จึงทำให้ฐานข้อมูลหลักฐานมีความสมบูรณ์น้อยลงและน่าเชื่อถือน้อยลงสำหรับกลุ่มประชากรที่ไม่ได้เป็นตัวแทนที่ดี

Definition

ความเบี่ยงเบนอย่างเป็นระบบในหลักฐานทางเภสัชพันธุกรรม ซึ่งกลุ่มตัวอย่างสำหรับการค้นพบ แผงอ้างอิง และการศึกษาเพื่อตรวจสอบความถูกต้อง มีการสุ่มตัวอย่างประชากรบางกลุ่มมากเกินไปอย่างไม่สมส่วน โดยเฉพาะอย่างยิ่งผู้ที่มีเชื้อสายยุโรป ทำให้เกิดการค้นพบและเครื่องมือที่สามารถนำไปใช้ได้ไม่เท่าเทียมกันในหมู่มนุษย์

Scope

หัวข้อนี้จะบันทึกขนาดของช่องว่างความหลากหลายในการวิจัยจีโนมิกส์และเภสัชพันธุศาสตร์ กลไกที่ทำให้เกิดอคติต่อผลการวิจัย และผลกระทบที่ตามมาต่อความเท่าเทียมกัน เป็นภาพรวมเชิงระเบียบวิธีและข้อมูลอ้างอิง โดยไม่มีข้อเสนอแนะทางคลินิก

Core questions

• ประชากรมีการเป็นตัวแทนที่ไม่เท่าเทียมกันเพียงใดในการวิจัยจีโนมิกส์และเภสัชพันธุศาสตร์?
• กลไกใดที่ทำให้การเป็นตัวแทนที่น้อยเกินไปทำให้เกิดอคติในการค้นพบ การระบุ และการตรวจสอบความถูกต้อง?
• ผลกระทบต่อความเท่าเทียมกันของช่องว่างความหลากหลายคืออะไร?
• โครงการริเริ่มใดที่กำลังขยายความหลากหลายของข้อมูลจีโนมิกส์?
• อคติจากการเป็นตัวแทนมีปฏิสัมพันธ์กับการถ่ายทอดของตัวทำนายทางพันธุกรรมอย่างไร?

Key concepts

• การเป็นตัวแทนที่มากเกินไปและการเป็นตัวแทนที่น้อยเกินไป
• อคติจากการค้นพบ
• องค์ประกอบของแผงอ้างอิง
• ความสามารถในการถ่ายทอด (การพกพา) ของตัวทำนาย
• การตีความและการจัดประเภทใหม่ของรูปแบบ
• ธนาคารชีวภาพและกลุ่มความร่วมมือที่มีความหลากหลาย (เช่น TOPMed, H3Africa, All of Us)
• ความเหลื่อมล้ำทางสุขภาพ

Mechanisms

อคติเกิดขึ้นได้หลายขั้นตอน กลุ่มตัวอย่างสำหรับการค้นพบที่ส่วนใหญ่มาจากผู้เข้าร่วมที่มีเชื้อสายยุโรปจะระบุรูปแบบที่พบบ่อยในกลุ่มนั้น ดังนั้นรูปแบบที่แพร่หลายในที่อื่นจึงมีโอกาสน้อยที่จะถูกค้นพบหรือระบุหน้าที่ แผงอ้างอิงที่รวบรวมจากข้อมูลที่มีความเบี่ยงเบนจะประมาณและตีความความหลากหลายได้ดีกว่าสำหรับประชากรที่เป็นตัวแทนที่ดี การศึกษาเพื่อตรวจสอบความถูกต้องที่ดำเนินการในกลุ่มเดียวกันจะยืนยันประสิทธิภาพในกลุ่มนั้น แต่ไม่ได้ทดสอบความสามารถในการนำไปใช้ทั่วไปในที่อื่น ด้วยเหตุนี้ ตัวทำนายทางพันธุกรรม ซึ่งรวมถึงคะแนนโพลีจีนิก มีแนวโน้มที่จะถ่ายทอดได้ไม่ดีในประชากรที่ไม่ได้เป็นตัวแทนที่ดี และรูปแบบในประชากรเหล่านั้นมักถูกจัดประเภทว่ามีความสำคัญไม่แน่นอน ประชากรแอฟริกาซึ่งมีความหลากหลายทางพันธุกรรมมากที่สุดได้รับผลกระทบเป็นพิเศษ เนื่องจากความหลากหลายส่วนใหญ่ของพวกเขาไม่มีอยู่ในทรัพยากรที่เน้นยุโรป

Clinical relevance

อคติจากการเป็นตัวแทนมีความสำคัญอย่างยิ่งในการตัดสินว่าการค้นพบหรือเครื่องมือทางเภสัชพันธุกรรมมีความน่าเชื่อถือสำหรับประชากรกลุ่มใด บทความนี้อธิบายว่าอคติเกิดขึ้นได้อย่างไรและผลกระทบต่อความสมบูรณ์ของหลักฐานอย่างไร ไม่ใช่แนวทางทางคลินิกและไม่ได้กล่าวถึงการทดสอบหรือการรักษาสำหรับแต่ละบุคคล

Epidemiology

การตรวจสอบการศึกษาที่เกี่ยวข้องกับจีโนมทั่วทั้งจีโนมและการศึกษาจีโนมิกส์พบซ้ำๆ ว่าผู้เข้าร่วมที่มีเชื้อสายยุโรปเป็นส่วนใหญ่ของผู้ที่ได้รับการศึกษา ซึ่งสูงกว่าสัดส่วนของประชากรโลกอย่างมาก ในขณะที่ประชากรแอฟริกา ละตินอเมริกา และประชากรเอเชียและชนพื้นเมืองจำนวนมากยังคงเป็นตัวแทนที่น้อยเกินไปอย่างเห็นได้ชัด ซึ่งเป็นช่องว่างที่ลดลงอย่างช้าๆ เท่านั้นแม้จะได้รับความสนใจอย่างต่อเนื่อง

History

ความกังวลเกี่ยวกับการขาดความหลากหลายในจีโนมิกส์ถูกทำให้ชัดเจนโดยการวิเคราะห์ของ Popejoy และ Fullerton ในปี 2016 ที่แสดงให้เห็นถึงความโดดเด่นของผู้เข้าร่วมที่มีเชื้อสายยุโรป และได้รับการเสริมด้วยการทบทวนของ Sirugo และคณะในปี 2019 ที่บันทึกการคงอยู่ของช่องว่าง Martin และคณะ (2019) ได้แสดงให้เห็นถึงอันตรายที่เป็นรูปธรรม นั่นคือประสิทธิภาพที่แย่ลงและอาจเพิ่มความเหลื่อมล้ำของคะแนนโพลีจีนิกในประชากรที่ไม่ใช่ยุโรป โครงการริเริ่มต่างๆ เช่น โครงการ NHLBI TOPMed, H3Africa และธนาคารชีวภาพขนาดใหญ่ที่มีความหลากหลายเกิดขึ้นส่วนหนึ่งเพื่อแก้ไขความไม่สมดุลนี้

Debates

เหตุใดช่องว่างความหลากหลายจึงยังคงอยู่แม้จะได้รับความสนใจ?

คำอธิบายรวมถึงโครงสร้างพื้นฐานการสรรหาบุคลากรที่ฝังรากลึก รูปแบบการระดมทุน ความไม่ไว้วางใจทางประวัติศาสตร์ในหมู่ชุมชนชายขอบ และความสะดวกสบายทางระเบียบวิธี ผู้แสดงความคิดเห็นไม่เห็นด้วยว่าปัจจัยใดที่มีประสิทธิภาพมากที่สุดในการปิดช่องว่าง

Key figures

• Alice B. Popejoy
• Stephanie M. Fullerton
• Sarah Tishkoff
• Alicia R. Martin
• Charles Rotimi

Seminal works

• popejoy-2016
• sirugo-2019
• martin-2019

Frequently asked questions

เหตุใดจึงสำคัญที่การวิจัยจีโนมิกส์ส่วนใหญ่ดำเนินการในประชากรที่มีเชื้อสายยุโรป?

การค้นพบเภสัชพันธุกรรม การตีความรูปแบบ และเครื่องมือทำนายจะถูกปรับเทียบตามประชากรที่ศึกษา เมื่อประชากรเหล่านั้นส่วนใหญ่เป็นเชื้อสายยุโรป ความรู้ที่ได้จะมีความสมบูรณ์น้อยลงและน่าเชื่อถือน้อยลงสำหรับประชากรกลุ่มอื่น ซึ่งนำไปสู่ความเหลื่อมล้ำทางสุขภาพ

การเพิ่มข้อมูลที่หลากหลายช่วยแก้ไขปัญหาหรือไม่?

การขยายความหลากหลายของกลุ่มตัวอย่างและแผงอ้างอิงเป็นสิ่งจำเป็นและช่วยได้ แต่ต้องจับคู่กับวิธีการวิเคราะห์ที่สามารถถ่ายทอดข้ามประชากรได้ และให้ความสนใจกับความไว้วางใจของชุมชนและผลประโยชน์ที่เท่าเทียมกัน