การทำคาริโอไทป์ระยะเมทาเฟสและการสร้างแถบสี
การทำคาริโอไทป์ระยะเมทาเฟสเป็นเทคนิคทางเซลล์พันธุศาสตร์แบบดั้งเดิมที่เซลล์ถูกหยุดในระยะเมทาเฟส โครโมโซมที่ควบแน่นจะถูกย้อมสีเพื่อสร้างรูปแบบแถบสีอ่อนและเข้มที่ทำซ้ำได้ จากนั้นโครโมโซมจะถูกจัดเรียงและตรวจสอบเป็นคาริโอไทป์ การสร้างแถบสีทำให้โครโมโซมแต่ละตัวสามารถระบุได้ และช่วยให้สามารถตรวจพบความผิดปกติเชิงตัวเลขและความผิดปกติเชิงโครงสร้างขนาดใหญ่ทั่วทั้งจีโนมได้ในการทดสอบครั้งเดียว
Definition
การทำคาริโอไทป์ระยะเมทาเฟสด้วยการสร้างแถบสีคือการวิเคราะห์ด้วยกล้องจุลทรรศน์ของโครโมโซมที่ถูกหยุดในระยะเมทาเฟสและย้อมสีเพื่อแสดงรูปแบบแถบสีที่เป็นลักษณะเฉพาะ ซึ่งใช้ในการกำหนดจำนวนโครโมโซมและตรวจจับการจัดเรียงโครงสร้างใหม่ที่มองเห็นได้ด้วยกล้องจุลทรรศน์
Scope
หัวข้อนี้ครอบคลุมถึงวิธีการเตรียมและย้อมสีโครโมโซมระยะเมทาเฟส วิธีการสร้างแถบสีหลัก (โดยเฉพาะ G-banding) คาริโอไทป์ในฐานะการนำเสนอที่เป็นมาตรฐาน และสิ่งที่การทำคาริโอไทป์แบบดั้งเดิมสามารถและไม่สามารถตรวจจับได้ เป็นข้อมูลอ้างอิงทางระเบียบวิธีวิจัยและไม่ได้ให้คำแนะนำในการจัดการทางคลินิก
Core questions
- เซลล์ที่กำลังแบ่งตัวถูกหยุดและประมวลผลอย่างไรเพื่อให้ได้โครโมโซมระยะเมทาเฟสที่สามารถวิเคราะห์ได้?
- อะไรที่ทำให้เกิดรูปแบบแถบสีที่ทำซ้ำได้ และ G-banding ทำงานอย่างไร?
- ขีดจำกัดความละเอียดโดยประมาณของการสร้างแถบสีแบบดั้งเดิมคือเท่าใด?
- ความผิดปกติใดบ้าง (เช่น การย้ายที่แบบสมดุล, ภาวะโพลีพลอยด์) ที่การทำคาริโอไทป์เท่านั้นที่สามารถเปิดเผยได้?
Key concepts
- การหยุดระยะเมทาเฟส (การยับยั้งสปินเดิลไมโทติก)
- รูปแบบแถบสีของโครโมโซม
- G-banding (จีมซา)
- คาริโอไทป์และไอดีโอแกรม
- ความละเอียดระดับแถบสี
- ความผิดปกติเชิงตัวเลขเทียบกับเชิงโครงสร้าง
- การจัดเรียงใหม่ที่สมดุล
- การตรวจจับโมเสก
Mechanisms
เซลล์ที่กำลังแบ่งตัวจะถูกหยุดในระยะเมทาเฟสโดยการยับยั้งการสร้างสปินเดิล จากนั้นจะถูกนำไปสัมผัสกับสารละลายไฮโปโทนิกที่ทำให้เซลล์พองตัวและสารตรึง และหยดลงบนสไลด์เพื่อให้โครโมโซมที่ควบแน่นกระจายตัว การย้อมสีจะสร้างรูปแบบแถบสีสลับกันที่ทำซ้ำได้ ในวิธีที่ใช้กันอย่างแพร่หลายที่สุด การบำบัดด้วยทริปซินอย่างอ่อนตามด้วยการย้อมสี Giemsa (G-banding) จะให้แถบสีเข้มและอ่อนที่สะท้อนความแตกต่างในองค์ประกอบของโครมาตินและการควบแน่น จากนั้นโครโมโซมที่มีแถบสีจะถูกจับคู่และจัดเรียงเป็นคาริโอไทป์ ซึ่งโครโมโซมแต่ละตัวจะถูกระบุด้วยขนาด ตำแหน่งเซนโทรเมียร์ และรูปแบบแถบสี เนื่องจากจีโนมทั้งหมดถูกตรวจสอบด้วยกล้องจุลทรรศน์ การทำคาริโอไทป์จึงตรวจจับการเพิ่มขึ้นหรือลดลงของโครโมโซมทั้งหมด การขาดหายและการเพิ่มขึ้นขนาดใหญ่ และโดยเฉพาะอย่างยิ่งการจัดเรียงใหม่ที่สมดุล (เช่น การย้ายที่แบบสลับกันและการผกผัน) และรูปแบบของโมเสกหลายรูปแบบ แม้ว่าความละเอียดจะจำกัดอยู่ที่ความผิดปกติประมาณหลายเมกะเบส
Clinical relevance
การทำคาริโอไทป์ถูกนำมาใช้เป็นเวลานานในการประเมินความผิดปกติของโครโมโซมที่สงสัย การแท้งบุตรซ้ำ และมะเร็งเม็ดเลือด และยังคงเป็นวิธีการอ้างอิงสำหรับการตรวจจับการจัดเรียงใหม่ที่สมดุลและภาวะโพลีพลอยด์ที่วิธีการวิเคราะห์จำนวนสำเนาที่มีความละเอียดสูงกว่าไม่สามารถตรวจพบได้ ข้อมูลนี้อธิบายถึงวิธีการสร้างผลการทำคาริโอไทป์ ไม่ใช่พื้นฐานสำหรับการตัดสินใจในการวินิจฉัยหรือการรักษาเฉพาะบุคคล
Evidence & guidelines
ผลการทำคาริโอไทป์จะถูกรายงานโดยใช้ระบบสากลสำหรับการตั้งชื่อไซโตจีโนมิกของมนุษย์ (ISCN) ซึ่งให้สัญกรณ์ที่เป็นมาตรฐานสำหรับการอธิบายชุดโครโมโซมปกติและผิดปกติในห้องปฏิบัติการต่างๆ
History
สาขาวิชานี้เป็นไปได้เมื่อ Tjio และ Levan ได้ยืนยันในปี 1956 ว่าเซลล์มนุษย์มีโครโมโซม 46 แท่ง Caspersson และคณะได้นำเสนอการสร้างแถบสีด้วยฟลูออเรสเซนต์ควินาคริในปลายทศวรรษ 1960 ซึ่งแสดงให้เห็นว่าโครโมโซมสามารถแยกแยะความแตกต่างตามความยาวได้ และวิธีการทริปซิน-จีมซาของ Seabright ในปี 1971 ได้ให้เทคนิค G-banding ที่เรียบง่ายและทนทาน ซึ่งทำให้การระบุโครโมโซมมนุษย์แต่ละตัวเป็นเรื่องปกติและเป็นรากฐานของเซลล์พันธุศาสตร์ทางคลินิกมานานหลายทศวรรษ
Key figures
- Joe Hin Tjio
- Albert Levan
- Torbjörn Caspersson
- Lore Zech
- Marina Seabright
Related topics
Seminal works
- tjio-levan-1956
- caspersson-1968
- seabright-1971
Frequently asked questions
- ทำไมเซลล์ต้องอยู่ในระยะเมทาเฟสสำหรับการทำคาริโอไทป์?
- โครโมโซมจะควบแน่นสูงสุดและแยกจากกันอย่างชัดเจนในระยะเมทาเฟส ดังนั้นการหยุดเซลล์ในระยะนั้นและกระจายออกไปจะช่วยให้สามารถนับและตรวจสอบการเปลี่ยนแปลงโครงสร้างของโครโมโซมแต่ละตัวได้
- คาริโอไทป์สามารถตรวจจับอะไรได้บ้างที่ไมโครอะเรย์ไม่สามารถทำได้?
- คาริโอไทป์สามารถเปิดเผยการจัดเรียงใหม่ที่สมดุล เช่น การย้ายที่แบบสลับกันและการผกผัน รวมถึงการเปลี่ยนแปลงของภาวะโพลีพลอยด์และรูปแบบของโมเสกหลายรูปแบบ เนื่องจากเป็นการแสดงภาพโครโมโซมทั้งหมด แทนที่จะวัดเฉพาะการเพิ่มขึ้นและการลดลงของจำนวนสำเนาเท่านั้น