การวิเคราะห์ความแปรผันของจำนวนสำเนาที่แตกต่างกัน — การวิเคราะห์ CNV / SCNA เปรียบเทียบ
การวิเคราะห์ความแปรผันของจำนวนสำเนาที่แตกต่างกัน (dCNV) ระบุบริเวณจีโนมที่มีความแตกต่างของจำนวนสำเนา DNA อย่างเป็นระบบระหว่างสองสภาวะ — เช่น เนื้อเยื่อเนื้องอกเทียบกับเนื้อเยื่อปกติ, กลุ่มผู้ป่วยเทียบกับกลุ่มควบคุม, หรือเซลล์ที่ได้รับการรักษาเทียบกับเซลล์ที่ไม่ได้รับการรักษา โดยการรวมข้อมูลความลึกของการอ่าน (read-depth) ระดับโพรบ หรือข้อมูลความเข้มของอาร์เรย์ (array-intensity) เข้ากับการแบ่งส่วนทางสถิติ (statistical segmentation) และการทดสอบระดับกลุ่ม (group-level testing) จะสามารถระบุการเพิ่มจำนวน (amplification) และการขาดหายไป (deletion) ของโซมาติก (somatic) ที่อาจเป็นสาเหตุของโรค และแยกแยะเหตุการณ์ขับเคลื่อนที่เกิดซ้ำ (recurrent driver events) ออกจากสัญญาณรบกวน (passenger noise) ทั่วทั้งกลุ่มตัวอย่าง
อ่านวิธีฉบับเต็ม
เข้าสู่ระบบด้วยบัญชีฟรีเพื่ออ่านส่วนนี้
แผนที่ระเบียบวิธี
ย่านของระเบียบวิธีที่เกี่ยวข้องกัน — เลือกโหนดเพื่อสำรวจ
แหล่งอ้างอิง
- Olshen, A. B., Venkatraman, E. S., Lucito, R., & Wigler, M. (2004). Circular binary segmentation for the analysis of array-based DNA copy number data. Biostatistics, 5(4), 557–572. DOI: 10.1093/biostatistics/kxh008 ↗
- Mermel, C. H., Schumacher, S. E., Hill, B., Meyerson, M. L., Beroukhim, R., & Getz, G. (2011). GISTIC2.0 facilitates sensitive and confident localization of the targets of focal somatic copy-number alteration in human cancers. Genome Biology, 12(4), R41. DOI: 10.1186/gb-2011-12-4-r41 ↗
วิธีอ้างอิงหน้านี้
ScholarGate. (2026, June 3). Differential Copy Number Variation Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/th/bioinformatics/differential-copy-number-variation-analysis
ระเบียบวิธีใด?
วางระเบียบวิธีนี้เคียงข้างระเบียบวิธีใกล้เคียงที่สุด แล้วอ่านเปรียบเทียบกัน — คลังวางหนังสือไว้บนโต๊ะให้แล้ว ส่วนการเลือกเป็นของท่าน
- การศึกษาความสัมพันธ์ทั่วทั้งจีโนม (GWAS)ชีวสารสนเทศศาสตร์↔ เปรียบเทียบ