การวิเคราะห์ความแปรผันของจำนวนสำเนาในเซลล์เดี่ยว
การวิเคราะห์ความแปรผันของจำนวนสำเนาในเซลล์เดี่ยว (scCNV) ตรวจจับการเพิ่มขึ้นและการลดลงของส่วนจีโนมภายในเซลล์แต่ละเซลล์ ช่วยให้นักวิจัยสามารถแก้ไขความแตกต่างภายในเนื้องอก (intratumor heterogeneity) สร้างวิวัฒนาการของโคลน (clonal evolution) และแยกความแตกต่างระหว่างเซลล์มะเร็งและเซลล์ปกติที่ความละเอียดระดับเซลล์เดี่ยว สามารถนำไปใช้กับข้อมูลการจัดลำดับจีโนมทั้งหมดของเซลล์เดี่ยว (single-cell whole-genome sequencing data) ได้โดยตรง หรืออนุมานจากสัญญาณความลึกของการอ่าน (read-depth signals) ในการทดลอง scRNA-seq หรือ scATAC-seq
อ่านวิธีฉบับเต็ม
เข้าสู่ระบบด้วยบัญชีฟรีเพื่ออ่านส่วนนี้
แผนที่ระเบียบวิธี
ย่านของระเบียบวิธีที่เกี่ยวข้องกัน — เลือกโหนดเพื่อสำรวจ
แหล่งอ้างอิง
- Garvin, T., Aboukhalil, R., Kendall, J., Baslan, T., Atwal, G. S., Hicks, J., Wigler, M., & Schatz, M. C. (2015). Interactive analysis and assessment of single-cell copy-number variations. Nature Methods, 12(11), 1058–1060. link ↗
- Gao, R., Bai, S., Henderson, Y. C., Lin, Y., Schalck, A., Yan, Y., Kumar, T., Hu, M., Sei, E., Davis, A., Wang, F., Shaitelman, S. F., Wang, J. R., Chen, K., Moulder, S., Lai, S. Y., & Navin, N. E. (2021). Delineating copy number and clonal substructure in human tumors from single-cell transcriptomes. Nature Biotechnology, 39(5), 599–608. link ↗
วิธีอ้างอิงหน้านี้
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Copy Number Variation Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/th/bioinformatics/single-cell-copy-number-variation-analysis
ระเบียบวิธีใด?
วางระเบียบวิธีนี้เคียงข้างระเบียบวิธีใกล้เคียงที่สุด แล้วอ่านเปรียบเทียบกัน — คลังวางหนังสือไว้บนโต๊ะให้แล้ว ส่วนการเลือกเป็นของท่าน
- การวิเคราะห์ความแปรผันของจำนวนสำเนาชีวสารสนเทศศาสตร์↔ เปรียบเทียบ
- การศึกษาความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมระดับเซลล์เดี่ยว (scEWAS)ชีวสารสนเทศศาสตร์↔ เปรียบเทียบ
- การศึกษาความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมทั่วทั้งจีโนมในระดับเซลล์เดี่ยวชีวสารสนเทศศาสตร์↔ เปรียบเทียบ
- การวิเคราะห์ Single-cell RNA-seqชีวสารสนเทศศาสตร์↔ เปรียบเทียบ
- Single-cell RNA-seq differential expressionชีวสารสนเทศศาสตร์↔ เปรียบเทียบ
- การระบุความแปรผันชีวสารสนเทศศาสตร์↔ เปรียบเทียบ