การวิเคราะห์ Hi-C
Hi-C (High-Chromosome Conformation Capture) เป็นเทคนิคและวิธีการคำนวณที่เกี่ยวข้องสำหรับการทำแผนที่สถาปัตยกรรม 3 มิติของจีโนมภายในเซลล์ Hi-C ซึ่งพัฒนาโดย Lieberman-Aiden และ Dekker ในปี 2009 สามารถระบุปฏิสัมพันธ์ทางกายภาพระหว่างบริเวณจีโนมที่อาจอยู่ห่างกันตามลำดับเชิงเส้น แต่ใกล้กันในเชิงพื้นที่ในนิวเคลียส 3 มิติ การวิเคราะห์ Hi-C ได้เปิดเผยหลักการพื้นฐานของการจัดระเบียบจีโนม รวมถึงการมีอยู่ของโดเมนที่เชื่อมต่อกันทางโทโพโลยี (topologically associating domains - TADs) และให้ข้อมูลเชิงลึกเกี่ยวกับวิธีการที่โครงสร้าง 3 มิติควบคุมการแสดงออกของยีนและการจำลองดีเอ็นเอ
อ่านวิธีฉบับเต็ม
เข้าสู่ระบบด้วยบัญชีฟรีเพื่ออ่านส่วนนี้
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
แหล่งอ้างอิง
- Lieberman-Aiden, E., van Berkum, N. L., Williams, L., Imakaev, M., Ragoczy, T., Telling, A., & Dekker, J. (2009). Comprehensive mapping of long-range interactions reveals folding principles of the human genome. Science, 326(5950), 289–293. DOI: 10.1126/science.1181369 ↗
- Dixon, J. R., Selvaraj, S., Yue, F., Kim, A., Li, Y., Shen, Y., & Ren, B. (2012). Topological domains in mammalian genomes identified by analysis of chromatin interactions. Nature, 485(7398), 376–380. DOI: 10.1038/nature11082 ↗
- Szabo, Q., Bantignies, F., & Cavalli, G. (2019). 3D chromatin architecture. Nature Reviews Molecular Cell Biology, 20(4), 207–220. link ↗
วิธีอ้างอิงหน้านี้
ScholarGate. (2026, June 3). Hi-C Analysis of 3D Genome Organization and Chromatin Interactions. ScholarGate. https://scholargate.app/th/genetics/hi-c-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- การวิเคราะห์ ATAC-seqพันธุศาสตร์↔ compare
- RNA Velocityพันธุศาสตร์↔ compare