การวิเคราะห์ความแปรปรวนของจำนวนสำเนาแบบเบย์ (Bayesian copy number variation analysis)
การวิเคราะห์ความแปรปรวนของจำนวนสำเนา (CNV) แบบเบย์เป็นกรอบการทำงานเชิงความน่าจะเป็นสำหรับการตรวจจับส่วนของจีโนมที่จำนวนสำเนา DNA ของบุคคลเบี่ยงเบนไปจากค่าปกติแบบทวิภาค (diploid norm) โดยการกำหนดการแจกแจงก่อน (prior distributions) เหนือสถานะจำนวนสำเนา และปรับปรุงการแจกแจงเหล่านั้นด้วยหลักฐานจาก array CGH, SNP array หรือข้อมูลการจัดลำดับลำดับเบส (sequencing read-depth) วิธีการนี้จะให้ความน่าจะเป็นภายหลัง (posterior probabilities) สำหรับแต่ละสถานะจำนวนสำเนาตามแนวของจีโนม ซึ่งให้การวัดปริมาณความไม่แน่นอนตามหลักการทางสถิติที่วิธีการแบ่งส่วนแบบบ่อยครั้ง (frequentist segmentation methods) ขาดไป
อ่านวิธีฉบับเต็ม
เข้าสู่ระบบด้วยบัญชีฟรีเพื่ออ่านส่วนนี้
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
แหล่งอ้างอิง
- Colella, S., Yau, C., Taylor, J. M., Mirza, G., Butler, H., Clouston, P., Bassett, A. S., Seller, A., Holmes, C. C., & Ragoussis, J. (2007). QuantiSNP: an Objective Bayes Hidden-Markov Model to detect and accurately map copy number variation using SNP genotyping data. Nucleic Acids Research, 35(6), 2013–2025. DOI: 10.1093/nar/gkm076 ↗
- Fridlyand, J., Snijders, A. M., Pinkel, D., Albertson, D. G., & Jain, A. N. (2004). Hidden Markov models approach to the analysis of array CGH data. Journal of Multivariate Analysis, 90(1), 132–153. DOI: 10.1016/j.jmva.2004.02.008 ↗
วิธีอ้างอิงหน้านี้
ScholarGate. (2026, June 3). Bayesian Copy Number Variation Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/th/bioinformatics/bayesian-copy-number-variation-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- การศึกษาความสัมพันธ์ทั่วทั้งจีโนมแบบเบย์ชีวสารสนเทศศาสตร์↔ compare
- Bayesian Variant Callingชีวสารสนเทศศาสตร์↔ compare
- การวิเคราะห์ความแปรผันของจำนวนสำเนาชีวสารสนเทศศาสตร์↔ compare
- การศึกษาความสัมพันธ์ทั่วทั้งจีโนม (GWAS)ชีวสารสนเทศศาสตร์↔ compare
- การวิเคราะห์ความแปรผันของจำนวนสำเนาในเซลล์เดี่ยวชีวสารสนเทศศาสตร์↔ compare
- การระบุความแปรผันชีวสารสนเทศศาสตร์↔ compare