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時系列エピゲノムワイド関連解析(time-series EWAS)

時系列エピゲノムワイド関連解析(time-series EWAS)は、古典的な横断的EWASデザインを縦断的設定に拡張したもので、同一被験者において複数の時点でのDNAメチル化をエピゲノム全体にわたって測定する。その目的は、メチル化レベルが時間とともに系統的に変化するCpGサイトを同定すること、あるいは曝露または表現型とのエピジェネティックな関連が発達段階、治療期間、または疾患の軌跡にわたってどのように進化するかを特徴づけることである。

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出典

  1. Pidsley, R., Zotenko, E., Peters, T. J., Lawrence, M. G., Risbridger, G. P., Molloy, P., ... & Clark, S. J. (2016). Critical evaluation of the Illumina MethylationEPIC BeadChip microarray for whole-genome DNA methylation profiling. Genome Biology, 17(1), 208. link
  2. Waterland, R. A., Kellermayer, R., Laritsky, E., Rayco-Solon, P., Harris, R. A., Travisano, M., ... & Prentice, A. M. (2010). Season of conception in rural Gambia affects DNA methylation at putative human metastable epialleles. PLoS Genetics, 6(12), e1001252. link

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ScholarGate. (2026, June 3). Longitudinal Epigenome-wide Association Study. ScholarGate. https://scholargate.app/ja/bioinformatics/time-series-epigenome-wide-association-study

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ScholarGateTime-series Epigenome-wide Association Study (Longitudinal Epigenome-wide Association Study). 2026-06-18に以下より取得 https://scholargate.app/ja/bioinformatics/time-series-epigenome-wide-association-study · データセット: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026