ScholarGate
Asisten
Process / pipelineBioinformatics / omics

Analisis Pengayaan Himpunan Gen Berbasis Jaringan

Analisis pengayaan himpunan gen berbasis jaringan (network GSEA) memperluas GSEA klasik dengan memasukkan jaringan interaksi biologis — seperti interaksi protein-protein (PPI) atau graf ko-ekspresi — ke dalam uji pengayaan. Alih-alih memperlakukan setiap gen secara independen, metode ini menyebarkan sinyal ekspresi diferensial melintasi tepi jaringan, memungkinkan gen yang teregulasi bersama atau terhubung secara fungsional untuk bersama-sama mendukung signifikansi suatu himpunan gen. Hasilnya adalah skor pengayaan yang koheren secara biologis yang memperhitungkan topologi jalur dan ketergantungan gen-gen.

Buka di MethodMindSegeraApply, compare, get guidance
Tools & resources
Unduh salindia
Learn & explore
VideoSegera

Baca metode selengkapnya

Khusus anggota

Masuk dengan akun gratis untuk membaca bagian ini.

Masuk

Peta metode

Lingkup metode terkait — pilih sebuah simpul untuk menjelajah.

Analisis Pengayaan Himpunan Gen Berbasis Jaringan
Analisis Pengayaan Set G…GWAS Berbasis JaringanAnalisis Pengayaan JalurAnalisis Ekspresi Difere…Analisis Pengayaan Himpu…Analisis Pengayaan Himpu…

Sumber

  1. Shojaie, A., & Michailidis, G. (2010). Network enrichment analysis in complex experiments. Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology, 9(1), Article 22. link ↗
  2. Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545-15550. link ↗

Cara menyitasi halaman ini

ScholarGate. (2026, June 3). Network-Based Gene Set Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/id/bioinformatics/network-based-gene-set-enrichment-analysis

Metode yang mana?

Letakkan metode ini berdampingan dengan kerabat terdekatnya dan baca secara bersisian — pustaka menata bukunya di atas meja; pilihan ada di tangan Anda.

Bandingkan berdampingan →

Dirujuk oleh

Analisis Pengayaan Set Gen (GSEA)Analisis Pengayaan Himpunan Gen Berbantuan Pembelajaran Mesin

Similar methods

Network-based pathway enrichment analysisNetwork-based RNA-seq differential expressionBayesian Gene Set Enrichment AnalysisGene Set Enrichment AnalysisPathway Enrichment AnalysisMulti-omics gene set enrichment analysisBayesian Pathway Enrichment AnalysisMachine learning-assisted gene set enrichment analysis

Related reference concepts

Pengayaan Jalur dan Analisis JaringanGenomik Fungsional dan Analisis JalurGenomika Sistem dan Biologi JaringanOntologi Gen dan Basis Data BiologisAnotasi Fungsional Varian GenomikTanda Tangan Ekspresi Gen dan Penanda Prognostik

Menemukan masalah di halaman ini? Laporkan atau usulkan perbaikan →

ScholarGate — Network-based gene set enrichment analysis (Network-Based Gene Set Enrichment Analysis). Diakses 2026-06-17 dari https://scholargate.app/id/bioinformatics/network-based-gene-set-enrichment-analysis · Set data: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026