ScholarGate
Asisten
Process / pipelineBioinformatics / omics

Analisis Keanekaragaman Mikrobioma Bayesian — Penilaian Probabilistik Struktur Komunitas

Analisis keanekaragaman mikrobioma Bayesian menerapkan model probabilistik — terutama kerangka kerja Dirichlet-Multinomial dan hierarkis terkait — pada data hitungan 16S rRNA atau metagenomik shotgun untuk memperkirakan alfa-keanekaragaman (kekayaan dan pemerataan dalam sampel) dan beta-keanekaragaman (perbedaan komposisi antar sampel) sambil menyebarkan ketidakpastian melalui seluruh rantai inferensi. Berbeda dengan pendekatan berbasis rarefaksi frekuentis, metode Bayesian memperlakukan hitungan takson sebagai sampel dari komposisi laten, memungkinkan interval kredibel pada metrik keanekaragaman dan perbandingan yang berprinsip di seluruh kelompok dengan kedalaman pengurutan yang tidak setara.

Buka di MethodMindSegeraVideoSegeraUnduh salindia

Baca metode selengkapnya

Khusus anggota

Masuk dengan akun gratis untuk membaca bagian ini.

Masuk

Peta metode

Lingkup metode terkait — pilih sebuah simpul untuk menjelajah.

Sumber

  1. Holmes, I., Harris, K., & Quince, C. (2012). Dirichlet Multinomial Mixtures: Generative Models for Microbial Metagenomics. PLOS ONE, 7(2), e30126. link
  2. La Rosa, P. S., Brooks, J. P., Deych, E., Boone, E. L., Edwards, D. J., Wang, Q., Sodergren, E., Weinstock, G., & Shannon, W. D. (2012). Hypothesis Testing and Power Calculations for Taxonomic-Based Human Microbiome Data. PLOS ONE, 7(12), e52078. link

Cara menyitasi halaman ini

ScholarGate. (2026, June 3). Bayesian Statistical Analysis of Microbiome Diversity. ScholarGate. https://scholargate.app/id/bioinformatics/bayesian-microbiome-diversity-analysis

Metode yang mana?

Letakkan metode ini berdampingan dengan kerabat terdekatnya dan baca secara bersisian — pustaka menata bukunya di atas meja; pilihan ada di tangan Anda.

Bandingkan berdampingan
ScholarGateBayesian Microbiome Diversity Analysis (Bayesian Statistical Analysis of Microbiome Diversity). Diakses 2026-06-15 dari https://scholargate.app/id/bioinformatics/bayesian-microbiome-diversity-analysis · Set data: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026