Alignement de séquences bayésien — Alignement probabiliste avec quantification de l'incertitude

L'alignement de séquences bayésien traite l'alignement de séquences biologiques (ADN, ARN ou protéines) comme un problème d'inférence probabiliste plutôt que comme une optimisation déterministe. Au lieu de renvoyer un alignement unique optimal, il échantillonne à partir d'une distribution a posteriori sur tous les alignements plausibles étant donné un modèle de substitution et des priors de pénalité d'insertion/délétion, quantifiant ainsi l'incertitude de l'alignement. Il est particulièrement précieux lorsque les analyses en aval, telles que l'inférence phylogénétique ou l'annotation fonctionnelle, sont sensibles aux erreurs d'alignement.