Analyse d'enrichissement de jeux de gènes basée sur les réseaux

L'analyse d'enrichissement de jeux de gènes basée sur les réseaux (network GSEA) étend la GSEA classique en intégrant des réseaux d'interaction biologique — tels que des graphes d'interaction protéine-protéine (IPP) ou de co-expression — dans le test d'enrichissement. Au lieu de traiter chaque gène indépendamment, la méthode propage les signaux de différentielle d'expression le long des arêtes du réseau, permettant aux gènes co-régulés ou fonctionnellement connectés de soutenir conjointement la significativité d'un jeu de gènes. Le résultat est un score d'enrichissement biologiquement cohérent qui prend en compte la topologie des voies et les dépendances entre gènes.