Analyse d'enrichissement bayésien de jeux de gènes — Score probabiliste de voies
L'analyse d'enrichissement bayésien de jeux de gènes (Bayesian GSEA) applique un cadre probabiliste pour déterminer si des ensembles prédéfinis de gènes — représentant des voies biologiques, des processus cellulaires ou des catégories fonctionnelles — sont collectivement plus différentiellement exprimés que ce que le hasard prédirait. Contrairement à la GSEA fréquentiste classique, l'approche bayésienne modélise explicitement l'incertitude dans les estimations d'expression, intègre des connaissances biologiques a priori et produit des probabilités a posteriori d'enrichissement plutôt que des p-valeurs brutes, permettant une inférence plus rigoureuse, en particulier dans les contextes à faible échantillon.
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Sources
- Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., ... & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: a knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545-15550. DOI: 10.1073/pnas.0506580102 ↗
- Newton, M. A., Quintana, F. A., Den Boon, J. A., Bhattacharya, S., & Ahlquist, P. (2007). Random-set methods identify distinct aspects of the enrichment signal in gene-set analysis. The Annals of Applied Statistics, 1(1), 85-106. link ↗
Comment citer cette page
ScholarGate. (2026, June 3). Bayesian Gene Set Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/fr/bioinformatics/bayesian-gene-set-enrichment-analysis
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- Analyse bayésienne de l'expression différentielle en RNA-seqBio-informatique↔ comparer
- Analyse d'enrichissement de jeux de gènes (GSEA)Bio-informatique↔ comparer
- Analyse d'enrichissement de jeux de gènes multi-omiquesBio-informatique↔ comparer
- Analyse d'enrichissement de voiesBio-informatique↔ comparer
- Analyse de l'expression différentielle par RNA-seqBio-informatique↔ comparer
- Analyse d'enrichissement de jeux de gènes unicellulaireBio-informatique↔ comparer
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