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Analyse d'enrichissement de voies bayésiennes

L'analyse d'enrichissement de voies bayésiennes teste si un ensemble prédéfini de gènes — une voie biologique — est systématiquement surreprésenté parmi les gènes qui montrent des preuves d'activité différentielle dans une expérience. Contrairement aux tests de surreprésentation classiques, elle encode les connaissances biologiques a priori sous forme de distribution a priori et la met à jour avec les données d'expression observées, produisant des probabilités a posteriori d'enrichissement plutôt que des p-valeurs. Ce cadre probabiliste gère naturellement les petits échantillons, les voies multiples et la propagation de l'incertitude dans un cadre statistique cohérent.

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Sources

  1. Baldi, P., & Long, A. D. (2001). A Bayesian framework for the analysis of microarray expression data: regularized t-test and statistical inferences of gene changes. Bioinformatics, 17(6), 509–519. DOI: 10.1093/bioinformatics/17.6.509
  2. Newton, M. A., Quintana, F. A., Den Boon, J. A., Bhattacharya, S., & Ahlquist, P. (2004). Random-set methods identify distinct aspects of the enrichment signal in gene-set analysis. The Annals of Applied Statistics, 1(1), 85–106. link

Comment citer cette page

ScholarGate. (2026, June 3). Bayesian Pathway Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/fr/bioinformatics/bayesian-pathway-enrichment-analysis

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ScholarGateBayesian Pathway Enrichment Analysis (Bayesian Pathway Enrichment Analysis). Consulté le 2026-06-15 sur https://scholargate.app/fr/bioinformatics/bayesian-pathway-enrichment-analysis · Jeu de données : https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026