تسمية الأليلات وتحديد الأنماط الفردانية

لا تُوصف الجينات الدوائية بالمتغيرات الفردية وحدها، بل بالأنماط الفردانية المسماة - وهي مجموعات من المتغيرات الموروثة معًا - باستخدام نظام الأليل النجمي الذي يكون فيه الأليل المرجعي هو *1، ويتلقى كل نمط فرداني متغير محدد رقمه الخاص. تتيح اتفاقية التسمية المشتركة هذه للمختبرات وقواعد البيانات والإرشادات الإشارة إلى نفس الأليل بشكل لا لبس فيه. يتناول هذا الموضوع كيفية تعريف الأنماط الفردانية للجينات الدوائية وتسميتها وتجميعها في أنماط مزدوجة.

Definition

تسمية الأليلات للجينات الدوائية هي التسمية الموحدة للأنماط الفردانية - وهي مجموعات من المتغيرات المتسلسلة الموروثة معًا على نفس الكروموسوم - عادةً باستخدام اسم الجين متبوعًا بعلامة نجمية ورقم (أليل نجمي)؛ وتحديد الأنماط الفردانية هو عملية تحديد الأنماط الفردانية التي يحملها الفرد.

Scope

يغطي هذا الموضوع تسمية الأليل النجمي (العلامة النجمية)، ومفهوم النمط الفرداني كمجموعة من المتغيرات الموروثة معًا، وعملية تحديد الأنماط الفردانية وتسمية النمط المزدوج من بيانات النمط الجيني، ودور موارد التسمية المنسقة في الحفاظ على اتساق تعريفات الأليلات. وهي مادة مرجعية حول اتفاقيات التسمية ولا تقدم إرشادات خاصة بالأدوية.

Core questions

• ما هو النمط الفرداني، وكيف يختلف عن المتغير الفردي؟
• كيف يسمي نظام الأليل النجمي الأنماط الفردانية للجينات الدوائية؟
• كيف يتم تحديد النمط المزدوج للشخص من بيانات النمط الجيني؟
• لماذا تعد التسمية المشتركة والمنسقة ضرورية عبر المختبرات وقواعد البيانات؟

Key concepts

• النمط الفرداني (مجموعة المتغيرات الموروثة معًا)
• تسمية الأليل النجمي (العلامة النجمية)
• الأليل المرجعي (*1) والأليلات المتغيرة المحددة
• النمط المزدوج (زوج من الأنماط الفردانية)
• تحديد طور النمط الفرداني وتسمية النمط المزدوج
• موارد تعريف الأليلات المنسقة

Mechanisms

يُعرّف النمط الفرداني للجين الدوائي بمتغير واحد أو أكثر من المتغيرات المتسلسلة التي تنتقل معًا على الكروموسوم؛ ويُعطى كل نمط فرداني مميز ومعترف به تسمية أليل نجمي، مع الإشارة إلى *1 تقليديًا على أنه الأليل المرجعي (ذو الوظيفة الطبيعية). يعني تحديد النمط المزدوج للفرد تحديد النمطين الفردانيين اللذين يحملهما، وهو ما يتطلب تحديد المتغيرات التي تقع على نفس الكروموسوم (تحديد الطور) - وهو أمر مباشر عندما تحدد المتغيرات أليلًا بشكل فريد، ولكنه أكثر تعقيدًا عندما يجب أخذ عدة متغيرات في الاعتبار معًا. تحتفظ قواعد البيانات المنسقة بالتعريفات، بحيث يعني نفس الأليل النجمي نفس المجموعة من المتغيرات في كل مكان يُستخدم فيه، ويمكن ربط كل أليل بوظيفة معينة.

Clinical relevance

تعد تسمية الأليلات المتسقة الأساس الذي يسمح بتطبيق التنبؤ بالنمط الظاهري الأيضي والإرشادات الجينية الدوائية بشكل قابل للتكرار، لأن تحديد النمط الظاهري يعتمد على التحديد الصحيح للأنماط الفردانية الموجودة. كمحتوى مرجعي، يشرح هذا الموضوع نظام التسمية وتحديد الأنماط الفردانية؛ ولا يقدم تعليمات وصفية، والتي تنتمي إلى الإرشادات السريرية المعتمدة التي يطبقها الأطباء المؤهلون.

Epidemiology

تختلف مجموعة الأنماط الفردانية المرصودة وتواتراتها عبر المجموعات السكانية الأصلية، وبعض الأليلات النجمية شائعة في مجموعة سكانية بينما نادرة في أخرى؛ وتهدف موارد التسمية الشاملة إلى التقاط هذا التنوع بحيث يكون تحديد الأنماط الفردانية دقيقًا عبر المجموعات.

History

نشأت تسمية الأليل النجمي مع إنزيمات السيتوكروم P450 وتم الحفاظ عليها لسنوات من خلال صفحات مخصصة لتسمية الأليلات. في عام 2018، انتقلت إدارة تسمية أليلات CYP البشرية إلى اتحاد تباين الجينات الدوائية (PharmVar)، والذي يعمل الآن كمستودع مركزي ومُصنّف لإصدارات تعريفات الأنماط الفردانية للجينات الدوائية، ويعمل جنبًا إلى جنب مع موارد المعرفة مثل PharmGKB.

Key figures

• Andrea Gaedigk
• Magnus Ingelman-Sundberg
• Teri Klein
• Michelle Whirl-Carrillo

Seminal works

• gaedigk-2017
• whirl-carrillo-2012

Frequently asked questions

ماذا يعني أليل نجمي مثل CYP2C19*2؟

إنه نمط فرداني مسمى: مجموعة محددة من المتغيرات المتسلسلة في جين CYP2C19 تم فهرستها وتعيين رقم ووظيفة لها، مما يسمح للمختبرات والإرشادات بالإشارة إليها باستمرار.

لماذا يتطلب تحديد الأنماط الفردانية أكثر من قراءة المتغيرات الفردية؟

لأن الأليل يُعرّف بالمتغيرات الموروثة معًا على نفس الكروموسوم، قد يتطلب تحديد النمط الفرداني تحديد الطور - تحديد المجموعة الموجودة - بدلاً من مجرد سرد كل متغير على حدة.