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单细胞时间序列RNA测序分析 — 单细胞分辨率下的时间转录组学
单细胞时间序列RNA测序分析能够捕捉多个时间点上的基因表达,从而揭示细胞群体在发育、分化或疾病进展等动态生物过程中如何出现、转变和分化。通过结合伪时间排序、RNA速度和差异动力学检验,研究人员可以重建单个细胞的时间轨迹,并识别驱动生物学转变的基因调控变化。
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来源
- Trapnell, C., Cacchiarelli, D., Grimsby, J., Pokharel, P., Li, S., Morse, M., Lennon, N. J., Livak, K. J., Mikkelsen, T. S., & Rinn, J. L. (2014). The dynamics and regulators of cell fate decisions are revealed by pseudotemporal ordering of single cells. Nature Biotechnology, 32(4), 381-386. DOI: 10.1038/nbt.2859 ↗
- La Manno, G., Soldatov, R., Zeisel, A., Braun, E., Hochgerner, H., Petukhov, V., Lidschreiber, K., Kastriti, M. E., Lonnerberg, P., Furlan, A., Fan, J., Borm, L. E., Liu, Z., van Bruggen, D., Guo, J., He, X., Linnarsson, S., & Kharchenko, P. V. (2018). RNA velocity of single cells. Nature, 560(7719), 494-498. DOI: 10.1038/s41586-018-0414-6 ↗
如何引用本页
ScholarGate. (2026, June 3). Time-Series Single-Cell RNA Sequencing Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/zh/bioinformatics/time-series-single-cell-rna-seq-analysis
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