Process / pipelineSingle-cell genomics
RNA Velocity
RNA velocity 是一种计算方法，它从单细胞 RNA 测序数据中推断单个细胞的未来发育状态。RNA velocity 分析由 La Manno 及其同事于 2018 年开发，通过分析单个细胞内未剪接 mRNA 转录本与已剪接 mRNA 转录本的比例来测量细胞状态转变的方向和速度。这使得在无需时间采样或操作的情况下即可预测细胞轨迹和分化途径，从而为发育和疾病过程中的细胞命运决定提供独特的见解。
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来源
- La Manno, G., Soldatov, R., Zeisel, A., Braun, E., Hochgerner, H., Petukhov, V., & Merad, M. (2018). RNA velocity of single cells. Nature, 560(7737), 494–498. DOI: 10.1038/s41586-018-0414-6 ↗
- Bergen, V., Lange, M., Peidli, S., Wolf, F. A., & Raj, B. (2020). Generalizing RNA velocity to transient cell states through smoothed differentiation of expected counts. Nature Biotechnology, 38(12), 1408–1417. DOI: 10.1038/s41587-020-0591-3 ↗
- Chen, H., & Albergante, L. (2022). scVelo: RNA velocity at single-cell resolution. bioRxiv. link ↗
如何引用本页
ScholarGate. (2026, June 3). RNA Velocity for Single-Cell Trajectory Inference. ScholarGate. https://scholargate.app/zh/genetics/rna-velocity
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