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单细胞RNA测序(scRNA-seq)的差异分析

单细胞RNA测序(scRNA-seq)差异分析是一种计算流程,它能在单细胞分辨率下比较不同生物学条件(例如,处理组与未处理组、疾病组与健康组或不同时间点)下的转录组谱。它能识别在不同条件下发生变化的基因、细胞类型和细胞状态,提供批量RNA测序比较无法提供的机制洞见。该方法结合了聚类、细胞类型注释和统计检验,通常使用伪批量(pseudobulk)聚合来考虑样本内的相关性。

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来源

  1. Hafemeister, C., & Satija, R. (2019). Normalization and variance stabilization of single-cell RNA-seq data using regularized negative binomial regression. Genome Biology, 20, 296. link
  2. Squair, J. W., Gautier, M., Kathe, C., Anderson, M. A., James, N. D., Hutson, T. H., Lefoulon, E., Tani, N., Bhatt, D. L., Rossetti, A., & Courtine, G. (2021). Confronting false discoveries in single-cell differential expression. Nature Communications, 12, 5692. link

如何引用本页

ScholarGate. (2026, June 3). Differential Single-Cell RNA Sequencing Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/zh/bioinformatics/differential-single-cell-rna-seq-analysis

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ScholarGateDifferential single-cell RNA-seq analysis (Differential Single-Cell RNA Sequencing Analysis). 于 2026-06-15 检索自 https://scholargate.app/zh/bioinformatics/differential-single-cell-rna-seq-analysis · 数据集: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026