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单细胞RNA测序(scRNA-seq)的差异分析
单细胞RNA测序(scRNA-seq)差异分析是一种计算流程,它能在单细胞分辨率下比较不同生物学条件(例如,处理组与未处理组、疾病组与健康组或不同时间点)下的转录组谱。它能识别在不同条件下发生变化的基因、细胞类型和细胞状态,提供批量RNA测序比较无法提供的机制洞见。该方法结合了聚类、细胞类型注释和统计检验,通常使用伪批量(pseudobulk)聚合来考虑样本内的相关性。
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来源
- Hafemeister, C., & Satija, R. (2019). Normalization and variance stabilization of single-cell RNA-seq data using regularized negative binomial regression. Genome Biology, 20, 296. link ↗
- Squair, J. W., Gautier, M., Kathe, C., Anderson, M. A., James, N. D., Hutson, T. H., Lefoulon, E., Tani, N., Bhatt, D. L., Rossetti, A., & Courtine, G. (2021). Confronting false discoveries in single-cell differential expression. Nature Communications, 12, 5692. link ↗
如何引用本页
ScholarGate. (2026, June 3). Differential Single-Cell RNA Sequencing Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/zh/bioinformatics/differential-single-cell-rna-seq-analysis
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