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单细胞系统发育分析 — 重建单细胞分辨率的谱系树

单细胞系统发育分析从单细胞测序数据中重建进化或发育树，追踪单个细胞如何从共同祖先分化而来。该方法通过利用体细胞突变、CRISPR引入的条形码或拷贝数改变作为可遗传特征，以前所未有的细胞分辨率绘制肿瘤、发育组织或免疫库内的克隆关系图。

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单细胞系统发育分析

拷贝数变异分析系统发育分析 Single-cell RNA-seq anal…变异检测

来源

Jones, M. G., Khodaverdian, A., Quinn, J. J., Chan, M. M., Hussmann, J. A., Wang, R., Xu, C., Weissman, J. S., & Yosef, N. (2020). Inference of single-cell phylogenies from lineage tracing data using Cassiopeia. Genome Biology, 21(1), 92. DOI: 10.1186/s13059-020-02000-8 ↗
Trapnell, C., Cacchiarelli, D., Grimsby, J., Pokharel, P., Li, S., Morse, M., Lennon, N. J., Livak, K. J., Mikkelsen, T. S., & Rinn, J. L. (2014). The dynamics and regulators of cell fate decisions are revealed by pseudotemporal ordering of single cells. Nature Biotechnology, 32(4), 381-386. DOI: 10.1038/nbt.2859 ↗

如何引用本页

ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Phylogenetic and Lineage Tree Reconstruction. ScholarGate. https://scholargate.app/zh/bioinformatics/single-cell-phylogenetic-analysis

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