การวิเคราะห์ความหลากหลายของจุลินทรีย์ในอนุกรมเวลา — การวิเคราะห์ความหลากหลายของจุลินทรีย์ตามช่วงเวลา
การวิเคราะห์ความหลากหลายของจุลินทรีย์ในอนุกรมเวลาจะติดตามว่าความอุดมสมบูรณ์ ความสม่ำเสมอ และองค์ประกอบของชุมชนจุลินทรีย์เปลี่ยนแปลงไปอย่างไรในช่วงเวลาหลายจุดภายในกลุ่มตัวอย่างเดียวกัน โดยการรวมเมตริกความหลากหลายมาตรฐานเข้ากับแบบจำลองทางสถิติแบบตามช่วงเวลา จะสามารถแยกพลวัตเชิงเวลาที่แท้จริงออกจากความแปรปรวนระหว่างบุคคลได้ โดยระบุว่าการรบกวน เช่น การเปลี่ยนแปลงอาหาร การรักษาด้วยยาปฏิชีวนะ หรือการเริ่มมีอาการของโรค ส่งผลต่อจุลินทรีย์เมื่อใดและอย่างไร
อ่านวิธีฉบับเต็ม
เข้าสู่ระบบด้วยบัญชีฟรีเพื่ออ่านส่วนนี้
แผนที่ระเบียบวิธี
ย่านของระเบียบวิธีที่เกี่ยวข้องกัน — เลือกโหนดเพื่อสำรวจ
แหล่งอ้างอิง
- Callahan, B. J., McMurdie, P. J., Rosen, M. J., Han, A. W., Johnson, A. J. A., & Holmes, S. P. (2016). DADA2: High-resolution sample inference from Illumina amplicon data. Nature Methods, 13(7), 581–583. DOI: 10.1038/nmeth.3869 ↗
- Chen, Y., Lun, A. T. L., & Smyth, G. K. (2023). Differential abundance testing on single-cell data using quasi-likelihood methods. Genome Biology, 24(1), 188. link ↗
วิธีอ้างอิงหน้านี้
ScholarGate. (2026, June 3). Longitudinal Microbiome Diversity Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/th/bioinformatics/time-series-microbiome-diversity-analysis
ระเบียบวิธีใด?
วางระเบียบวิธีนี้เคียงข้างระเบียบวิธีใกล้เคียงที่สุด แล้วอ่านเปรียบเทียบกัน — คลังวางหนังสือไว้บนโต๊ะให้แล้ว ส่วนการเลือกเป็นของท่าน
- การวิเคราะห์ความหลากหลายของไมโครไบโอมแบบหลายโอไมกส์ชีวสารสนเทศศาสตร์↔ เปรียบเทียบ
- การวิเคราะห์ความอุดมสมบูรณ์ของวิถีชีวภาพชีวสารสนเทศศาสตร์↔ เปรียบเทียบ
- การแสดงออกแตกต่างกันของ RNA-seqชีวสารสนเทศศาสตร์↔ เปรียบเทียบ
- การวิเคราะห์ Single-cell RNA-seqชีวสารสนเทศศาสตร์↔ เปรียบเทียบ
- การแสดงออกที่แตกต่างกันของ RNA-seq แบบอนุกรมเวลาชีวสารสนเทศศาสตร์↔ เปรียบเทียบ