การระบุความแปรผันระดับเซลล์เดี่ยว — การตรวจหาการกลายพันธุ์ที่ความละเอียดระดับเซลล์
การระบุความแปรผันระดับเซลล์เดี่ยว (Single-cell variant calling) เป็นกระบวนการทางชีวสารสนเทศที่ระบุความแปรผันของลำดับดีเอ็นเอ เช่น ความแปรผันของนิวคลีโอไทด์เดี่ยว (SNVs) การแทรกและการลบขนาดเล็ก และการเปลี่ยนแปลงจำนวนสำเนา ภายในเซลล์แต่ละเซลล์ แทนที่จะเป็นการวิเคราะห์จากเนื้อเยื่อรวม ด้วยการแยกแยะภูมิทัศน์ของการกลายพันธุ์แบบเซลล์ต่อเซลล์ ทำให้สามารถเปิดเผยความหลากหลายภายในเนื้องอก โครงสร้างโคลน และรูปแบบการกลายพันธุ์ทางกายภาพที่การจัดลำดับแบบรวมไม่สามารถทำได้ วิธีการนี้มีความสำคัญอย่างยิ่งต่อจีโนมิกส์มะเร็ง ชีววิทยาพัฒนาการ และการศึกษาใด ๆ ที่ความหลากหลายทางพันธุกรรมแบบเซลล์ต่อเซลล์เป็นคำถามหลัก
อ่านวิธีฉบับเต็ม
เข้าสู่ระบบด้วยบัญชีฟรีเพื่ออ่านส่วนนี้
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
แหล่งอ้างอิง
- Zafar, H., Wang, Y., Nakhleh, L., Navin, N., & Chen, K. (2016). Monovar: single-nucleotide variant detection in single cells. Nature Methods, 13(6), 505–507. DOI: 10.1038/nmeth.3835 ↗
- Singer, J., Ruscheweyh, H. J., Doherr, M. G., Stadler, T., & Althaus, C. L. (2021). Single-nucleotide variant calling in single-cell sequencing data with piccolo. BMC Bioinformatics, 22(1), 333. link ↗
วิธีอ้างอิงหน้านี้
ScholarGate. (2026, June 3). Single-Cell Genomic Variant Calling. ScholarGate. https://scholargate.app/th/bioinformatics/single-cell-variant-calling
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- การวิเคราะห์ความแปรผันของจำนวนสำเนาชีวสารสนเทศศาสตร์↔ compare