Single-cell Phylogenetic Analysis — การสร้างแผนภูมิต้นไม้สายวิวัฒนาการในระดับเซลล์เดี่ยว
การวิเคราะห์ไฟโลเจเนติกส์ระดับเซลล์เดี่ยวเป็นการสร้างแผนภูมิต้นไม้เชิงวิวัฒนาการหรือการพัฒนาจากข้อมูลการจัดลำดับเซลล์เดี่ยว เพื่อติดตามว่าเซลล์แต่ละเซลล์แยกออกจากบรรพบุรุษร่วมกันได้อย่างไร โดยใช้ประโยชน์จากการกลายพันธุ์ของโซมาติก, บาร์โค้ดที่ถูกแนะนำโดย CRISPR, หรือการเปลี่ยนแปลงจำนวนสำเนาเป็นลักษณะทางพันธุกรรม วิธีการนี้จะสร้างแผนที่ความสัมพันธ์ของโคลนภายในเนื้องอก, เนื้อเยื่อที่กำลังพัฒนา, หรือคลังภูมิคุ้มกัน ด้วยความละเอียดของเซลล์ที่ไม่เคยมีมาก่อน
อ่านวิธีฉบับเต็ม
เข้าสู่ระบบด้วยบัญชีฟรีเพื่ออ่านส่วนนี้
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
แหล่งอ้างอิง
- Jones, M. G., Khodaverdian, A., Quinn, J. J., Chan, M. M., Hussmann, J. A., Wang, R., Xu, C., Weissman, J. S., & Yosef, N. (2020). Inference of single-cell phylogenies from lineage tracing data using Cassiopeia. Genome Biology, 21(1), 92. DOI: 10.1186/s13059-020-02000-8 ↗
- Trapnell, C., Cacchiarelli, D., Grimsby, J., Pokharel, P., Li, S., Morse, M., Lennon, N. J., Livak, K. J., Mikkelsen, T. S., & Rinn, J. L. (2014). The dynamics and regulators of cell fate decisions are revealed by pseudotemporal ordering of single cells. Nature Biotechnology, 32(4), 381-386. DOI: 10.1038/nbt.2859 ↗
วิธีอ้างอิงหน้านี้
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Phylogenetic and Lineage Tree Reconstruction. ScholarGate. https://scholargate.app/th/bioinformatics/single-cell-phylogenetic-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- การวิเคราะห์ความแปรผันของจำนวนสำเนาชีวสารสนเทศศาสตร์↔ compare
- การวิเคราะห์วิวัฒนาการชาติพันธุ์ชีวสารสนเทศศาสตร์↔ compare
- การวิเคราะห์ Single-cell RNA-seqชีวสารสนเทศศาสตร์↔ compare
- การระบุความแปรผันชีวสารสนเทศศาสตร์↔ compare