Вторичные и случайные находки

Вторичные и случайные находки — это генетические результаты, выходящие за рамки первоначальной причины тестирования. Случайные находки обнаруживаются неожиданно, в то время как вторичные находки активно ищутся в определенном наборе генов независимо от основного показания к тесту. Оба типа находок поднимают вопрос о том, какие результаты следует искать и сообщать, когда широкое секвенирование неизбежно выявляет больше, чем было запрошено.

Definition

Вторичные находки — это результаты в заранее определенном наборе генов, которые целенаправленно анализируются и сообщаются независимо от показания к тестированию, тогда как случайные находки — это клинически значимые результаты, обнаруженные неожиданно во время анализа, направленного на решение другой задачи.

Scope

Тема различает случайные и вторичные находки, описывает обоснование для поддержания определенного, периодически обновляемого списка генов, рассматриваемых для целенаправленного вторичного анализа, и излагает критерии, такие как клиническая применимость (actionability), используемые для определения того, какие гены должны быть включены в такой список. Она затрагивает интерпретационную и политическую структуру вокруг незапрошенных результатов, а не индивидуальные клинические решения об их возврате.

Core questions

• Чем вторичные находки отличаются от случайных?
• Зачем поддерживать определенный список генов для целенаправленного вторичного анализа?
• Какие критерии, например клиническая применимость, определяют, какие гены включаются?
• Как список меняется по мере развития доказательной базы?

Key concepts

• Случайные против вторичных находок
• Определенный список генов для вторичных находок
• Клиническая применимость
• Отказ и выбор пациента
• Периодический пересмотр списка
• Объем отчетности при широком секвенировании

Mechanisms

Когда экзомное или геномное секвенирование выполняется по одному показанию, данные неизбежно содержат информацию о многих других генах. Для систематической обработки этой информации профессиональные рекомендации определили минимальный список генов, в которых известные патогенные варианты должны целенаправленно искаться и сообщаться как вторичные находки, выбранные в основном потому, что связанные с ними состояния считаются медицински применимыми (Green et al., 2013). Список не является фиксированным: он пересматривался и расширялся в последующих версиях по мере изменения доказательств и консенсуса (Miller et al., 2021; Miller et al., 2023). Случайные находки, напротив, не являются заранее определенными, а возникают неожиданно в ходе первичного анализа.

Clinical relevance

Обработка незапрошенных результатов является центральной проблемой интерпретации и консультирования при широком геномном тестировании, включая определение объема отчетности и соблюдение выбора пациента. Тема описывает рамки и критерии для вторичных и случайных находок; это справочное описание, которое не указывает, следует ли и как сообщать о какой-либо конкретной находке отдельному лицу.

Epidemiology

Поскольку вторичные находки ищутся в определенном наборе генов, доля людей с подлежащей сообщению вторичной находкой зависит от включенных генов и исследуемой популяции; расширение списка в разных версиях изменяет ожидаемый выход (Miller et al., 2021; Miller et al., 2023).

History

По мере роста клинического экзомного и геномного секвенирования вопрос о незапрошенных результатах стал неизбежным, и в заявлении о политике 2013 года был введен определенный минимальный список генов, подлежащих исследованию на предмет подлежащих сообщению вторичных находок, отобранных по критерию клинической применимости (Green et al., 2013). С тех пор список поддерживался и периодически обновлялся в последующих версиях, отражая накопление доказательств и меняющийся консенсус относительно того, какие гены заслуживают включения (Miller et al., 2021; Miller et al., 2023).

Debates

Какие гены должны быть в списке вторичных находок, и должны ли пациенты иметь возможность отказаться?

Вопрос о том, какие гены соответствуют критерию клинической применимости для целенаправленного сообщения, и как учитывать предпочтения пациентов отказаться, оспаривался с момента введения списка и формировал его последующие пересмотры.

Key figures

• Robert C. Green
• David T. Miller
• Leslie Biesecker

Seminal works

• green-2013
• miller-2021
• miller-2023

Frequently asked questions

В чем разница между вторичной и случайной находкой?

Вторичная находка целенаправленно ищется в заранее определенном наборе генов независимо от причины назначения теста, тогда как случайная находка обнаруживается неожиданно при анализе по первоначальному вопросу.

Почему существует определенный список генов для вторичных находок?

Широкое секвенирование выявляет гораздо больше, чем первоначальный вопрос, поэтому определенный список, выбранный в основном по критерию медицинской применимости, обеспечивает последовательный, основанный на доказательствах объем для целенаправленного изучения и сообщения дополнительных результатов.