Анализ CRISPR-скрининга
Анализ CRISPR-скрининга обрабатывает данные из пулированных генетических скринингов с использованием CRISPR-Cas9 для идентификации генов, необходимых для роста, выживания или фенотипа клеток в специфических условиях. Эта вычислительная конвейерная линия, разработанная Чжаном, Санджаной и другими, преобразует результаты секвенирования обилия направляющих РНК в ранжированные списки функциональных генов.
Читать метод полностью
Войдите с бесплатным аккаунтом, чтобы прочитать этот раздел.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Источники
- Shalem, O., Sanjana, N. E., Hartenian, E., Shi, X., Scott, D. A., Mikkelsen, T. S., ... & Zhang, F. (2014). Genome-scale CRISPR-Cas9 knockout screening in human cells. Science, 343(6166), 84-87. DOI: 10.1126/science.1247005 ↗
- Hart, T., Chandrashekhar, M., Aregger, M., Steinhart, Z., Brown, K. R., MacLeod, G., ... & Moffat, J. (2015). High-resolution CRISPR screens reveal fitness genes and pathways. Molecular Systems Biology, 11(8), 820. link ↗
- King, J. B., Palmer, A. C., & Sorger, P. K. (2020). Application of a genetic algorithm designed for flexible objective optimization in pharmaceutical research and development. Cancer Research, 79(13 Supplement), 3435. link ↗
Как цитировать эту страницу
ScholarGate. (2026, June 3). CRISPR Screening Data Analysis and Hit Identification. ScholarGate. https://scholargate.app/ru/bioinformatics/crispr-screen-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Де ново сборка транскриптомаБиоинформатика↔ compare
- Поиск по профилю HMMERБиоинформатика↔ compare
- Метагеномный биннингБиоинформатика↔ compare
Упоминается в
Нашли ошибку на этой странице? Сообщите о ней или предложите исправление →