Фармакогеномное тестирование и клиническое применение

Фармакогеномное тестирование измеряет генетические варианты пациента в генах, имеющих отношение к реакции на лекарства, а клиническое применение — это работа по преобразованию этих результатов в пригодную для использования информацию в момент назначения. Эта тема охватывает, как проводятся и сообщаются фармакогеномные тесты, как результаты преобразуются в прогнозируемые фенотипы и что требуется для надежной доставки этой информации в рамках систем здравоохранения.

Definition

Фармакогеномное тестирование — это лабораторное определение генотипа индивидуума для фармакогенов; клиническое применение — это набор процессов (интерпретация, сопоставление с рекомендациями, поддержка принятия решений и доставка), которые делают эти результаты применимыми в рутинной практике.

Scope

Статья охватывает методы молекулярной диагностики, используемые для фармакогеномного тестирования, различие между реактивным (одногенным, по требованию) и превентивным (панельным, результаты хранятся заранее) тестированием, преобразование генотипа в фенотип и клинические рекомендации, а также инфраструктуру внедрения, такую как поддержка принятия клинических решений. Это справочный обзор, который не предписывает тестирование или назначение лекарств для отдельных лиц.

Core questions

• Как измеряются и сообщаются фармакогеномные варианты?
• Когда реактивное тестирование предпочтительнее превентивного панельного тестирования?
• Как генотип преобразуется в фенотип и рекомендацию по назначению?
• Какая инфраструктура необходима для доставки результатов в момент оказания медицинской помощи?

Key concepts

• Генотипирование против секвенирования
• Таргетные панели вариантов
• Реактивное против превентивного (панельного) тестирования
• Таблицы преобразования генотипа в фенотип
• Интеграция поддержки принятия клинических решений
• Переносимость результатов и стандарты отчетности
• Валидность теста и клиническая полезность

Mechanisms

Большинство фармакогеномных тестов исследуют определенный набор известных вариантов с помощью таргетного генотипирования, хотя все шире используется более широкое секвенирование; результаты обычно сообщаются как диплотип и предполагаемый метаболизатор или функциональный фенотип. Внедрение связывает этот фенотип с рецензируемыми рекомендациями и, в развитых системах, выводит его через электронную поддержку принятия клинических решений, чтобы информация доходила до врача, когда назначается соответствующий препарат. Поскольку генотип стабилен на протяжении всей жизни человека, превентивное панельное тестирование сохраняет результаты для будущего использования, тогда как реактивное тестирование касается одного решения о препарате в момент его возникновения (Swen et al., 2011; Wang, McLeod & Weinshilboum, 2011).

Clinical relevance

Эффективное тестирование и внедрение определяют, доходят ли фармакогеномные знания до пациента, и понимание их требований является центральным для клинической фармакологии и лабораторной медицины. Эта статья описывает, как тестирование и внедрение работают в качестве справочного материала; это не рекомендация тестировать или изменять терапию для какого-либо конкретного пациента.

Epidemiology

Поскольку клинически значимые варианты распространены, превентивное панельное тестирование обычно дает по крайней мере один применимый результат для подавляющего большинства протестированных лиц, что является частью обоснования панельных подходов; однако внедрение и доступность поддержки принятия решений широко варьируются в разных системах здравоохранения (Wang, McLeod & Weinshilboum, 2011).

Evidence & guidelines

Внедрение основывается на консорциумах, разрабатывающих рекомендации, — в частности, Консорциуме по внедрению клинической фармакогенетики (CPIC) и Голландской рабочей группе по фармакогенетике (DPWG), — которые преобразуют генотип в градуированные рекомендации по назначению, а также на курируемых базах знаний, таких как PharmGKB; регуляторы также включают фармакогеномную информацию в маркировку лекарств (Swen et al., 2011; Lee et al., 2022; Hicks et al., 2015).

History

Одногенные фармакогенетические тесты вошли в практику для отдельных препаратов с конца двадцатого века. Разработка стандартизированных рекомендаций по преобразованию генотипа в фенотип CPIC и DPWG, наряду с электронными медицинскими картами и поддержкой принятия решений, сместила внимание с отдельных тестов на систематические, часто превентивные, программы внедрения в 2010-х годах.

Debates

Реактивное одногенное тестирование против превентивного панельного тестирования

Превентивные панели предлагают немедленные результаты при последующем назначении препарата, но требуют инфраструктуры для хранения и повторного вывода результатов, в то время как реактивное тестирование проще для каждого эпизода; баланс стоимости, полезности и осуществимости остается предметом споров.

Демонстрация клинической полезности

Критики отмечают, что аналитическая валидность хорошо установлена для многих анализов, но высококачественные доказательства того, что тестирование улучшает клинические исходы, сильнее для некоторых пар ген-препарат, чем для других, что формирует разногласия относительно того, какие тесты оправдывают рутинное использование.

Key figures

• Jesse Swen
• Kelly Caudle
• Mary Relling
• Teri Klein
• Howard McLeod

Seminal works

• swen-2011
• hicks-2015
• lee-2022

Frequently asked questions

В чем разница между реактивным и превентивным фармакогеномным тестированием?

Реактивное тестирование назначается для принятия конкретного решения о препарате в момент его возникновения, тогда как превентивное тестирование генотипирует панель заранее и сохраняет результаты, чтобы они были доступны, когда впоследствии рассматривается соответствующий препарат.

Почему поддержка принятия клинических решений подчеркивается при внедрении?

Потому что сохраненный генотип полезен только в том случае, если правильная интерпретация доходит до врача в нужное время; встраивание оповещений и рекомендаций в электронную медицинскую карту — это то, как многие программы доставляют эту информацию в момент оказания медицинской помощи.