Análise de Enriquecimento de Conjuntos de Genes de Célula Única — scGSEA
A análise de enriquecimento de conjuntos de genes de célula única (scGSEA) estende a GSEA clássica de bulk para a resolução de células individuais. Em vez de testar se um conjunto de genes está enriquecido em uma comparação em nível de amostra, a scGSEA atribui uma pontuação de enriquecimento ou atividade a cada célula, permitindo que os pesquisadores mapeiem a atividade de vias em populações celulares heterogêneas, estados celulares e trajetórias de desenvolvimento capturadas em dados de RNA-seq de célula única.
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Fontes
- Aibar, S., Gonzalez-Blas, C. B., Moerman, T., Huynh-Thu, V. A., Imrichova, H., Hulselmans, G., Rambow, F., Marine, J.-C., Geurts, P., Aerts, J., van den Oord, J., Kalender Atak, Z., Wouters, J., & Aerts, S. (2017). SCENIC: Single-cell regulatory network inference and clustering. Nature Methods, 14(11), 1083-1086. link ↗
- DeTomaso, D., Jones, M. G., Subramaniam, M., Ashuach, T., Ye, C. J., & Yosef, N. (2019). Functional interpretation of single cell similarity maps. Nature Communications, 10(1), 4376. link ↗
Como citar esta página
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Gene Set Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/pt/bioinformatics/single-cell-gene-set-enrichment-analysis
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- Análise de Expressão Diferencial de RNA-seq de Célula ÚnicaBioinformática↔ comparar
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