Análise de Enriquecimento de Conjuntos de Genes Assistida por Aprendizado de Máquina
A análise de enriquecimento de conjuntos de genes assistida por aprendizado de máquina (ML-GSEA) estende o framework clássico de GSEA incorporando modelos de ML supervisionados ou não supervisionados — como florestas aleatórias, redes neurais ou arquiteturas de aprendizado profundo — para melhorar a detecção, classificação e interpretação biológica de conjuntos de genes enriquecidos a partir de dados de expressão de alto rendimento. A abordagem é particularmente valiosa para relações complexas e não lineares entre conjuntos de genes que as estatísticas clássicas de enriquecimento podem não capturar.
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Fontes
- Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545–15550. DOI: 10.1073/pnas.0506580102 ↗
- Ma, J., Yu, M. K., Fong, S., Ono, K., Sage, E., Demchak, B., Sharan, R., & Ideker, T. (2018). Using deep learning to model the hierarchical structure and function of a cell. Nature Methods, 15(4), 290–298. DOI: 10.1038/nmeth.4627 ↗
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ScholarGate. (2026, June 3). Machine Learning-Assisted Gene Set Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/pt/bioinformatics/machine-learning-assisted-gene-set-enrichment-analysis
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- Análise de Enriquecimento de Conjunto de Genes (GSEA)Bioinformática↔ comparar
- Análise de Enriquecimento de Conjuntos de Genes Baseada em RedeBioinformática↔ comparar
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