Differentiële analyse van single-cell RNA-seq

Differentiële analyse van single-cell RNA-seq (scRNA-seq) is een computationele pijplijn die transcriptoomprofielen vergelijkt tussen biologische condities — zoals behandeld versus onbehandeld, ziekte versus gezond, of tijdspunten — op resolutie van individuele cellen. Het identificeert welke genen, celtypen en celstaten veranderen tussen condities, en biedt mechanistisch inzicht dat vergelijkingen van bulk RNA-seq niet kunnen bieden. De aanpak combineert clustering, celtype-annotatie en statistisch testen, waarbij doorgaans pseudobulk-aggregatie wordt gebruikt om rekening te houden met correlatie binnen monsters.