RNA Velocity
RNA velocity is een computationele methode die de toekomstige ontwikkelingsstaat van individuele cellen afleidt uit single-cell RNA-sequencingdata. Ontwikkeld door La Manno en collega's in 2018, meet RNA velocity-analyse de richting en snelheid van celstaatovergangen door de verhouding van gesplicede versus ongesplicede mRNA-transcripten binnen individuele cellen te analyseren. Dit maakt de voorspelling van celtrajecten en differentiatiepaden mogelijk zonder dat temporele bemonstering of manipulatie vereist is, en biedt unieke inzichten in celkeuzes tijdens ontwikkeling en ziekte.
Lees de volledige methode
Log in met een gratis account om dit onderdeel te lezen.
Methodenkaart
De omgeving van verwante methoden — selecteer een knooppunt om te verkennen.
Bronnen
- La Manno, G., Soldatov, R., Zeisel, A., Braun, E., Hochgerner, H., Petukhov, V., & Merad, M. (2018). RNA velocity of single cells. Nature, 560(7737), 494–498. DOI: 10.1038/s41586-018-0414-6 ↗
- Bergen, V., Lange, M., Peidli, S., Wolf, F. A., & Raj, B. (2020). Generalizing RNA velocity to transient cell states through smoothed differentiation of expected counts. Nature Biotechnology, 38(12), 1408–1417. DOI: 10.1038/s41587-020-0591-3 ↗
- Chen, H., & Albergante, L. (2022). scVelo: RNA velocity at single-cell resolution. bioRxiv. link ↗
Deze pagina citeren
ScholarGate. (2026, June 3). RNA Velocity for Single-Cell Trajectory Inference. ScholarGate. https://scholargate.app/nl/genetics/rna-velocity
Welke methode?
Plaats deze methode naast haar naaste verwanten en lees ze naast elkaar — de bibliotheek legt de boeken op tafel; de keuze is aan u.
- ATAC-seq AnalyseGenetica↔ vergelijken
- Hi-C AnalyseGenetica↔ vergelijken
Geciteerd door
Een fout op deze pagina gezien? Meld het of stel een correctie voor →