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シングルセルエピゲノムワイド関連解析 (scEWAS)

シングルセルエピゲノムワイド関連解析 (scEWAS) は、ゲノム全体にわたるエピジェネティックマーク(主にDNAメチル化またはクロマチンアクセシビリティ)をシングルセル解像度で調査し、それらのマークの変動を表現型、疾患、または曝露と統計的に関連付けます。バルクEWASでは分離できない細胞タイプの不均一性を解決することにより、scEWASは、組織全体で平均化されるのではなく、希少または混合された細胞集団に特異的なエピジェネティックシグナルを特定します。

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出典

  1. Zhang, Y., et al. (2022). Single-cell epigenome analysis reveals age-associated decay of heterochromatin domains in excitatory neurons in the mouse brain. Cell Research, 32(1), 1-18. link
  2. Aryee, M. J., et al. (2014). Minfi: a flexible and comprehensive Bioconductor package for the analysis of Infinium DNA methylation microarrays. Bioinformatics, 30(10), 1363-1369. DOI: 10.1093/bioinformatics/btu049

このページの引用方法

ScholarGate. (2026, June 3). Single-Cell Epigenome-Wide Association Study. ScholarGate. https://scholargate.app/ja/bioinformatics/single-cell-epigenome-wide-association-study

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