स्रोत पहचान और संचरण शृंखलाएँ

किसी प्रकोप के स्रोत की पहचान करना और यह पुनर्निर्माण करना कि संक्रमण एक व्यक्ति या माध्यम से दूसरे व्यक्ति तक कैसे पहुँचा, किसी जाँच का विश्लेषणात्मक केंद्र होता है। स्रोत पहचान यह पूछती है कि एजेंट कहाँ से आया, जबकि संचरण-शृंखला विश्लेषण यह पूछता है कि यह कैसे फैला, मामलों को इस क्रम में जोड़ते हुए कि किसने किसे संक्रमित किया और मार्ग, सूचकांक मामले (index case) और किसी भी प्रवर्धक घटनाओं (amplifying events) को प्रकट करता है।

Definition

स्रोत पहचान किसी प्रकोप के उद्गम, माध्यम या जलाशय का निर्धारण है, और संचरण-शृंखला पुनर्निर्माण महामारी विज्ञान, लौकिक और तेजी से जीनोमिक साक्ष्य का उपयोग करके, व्यक्ति-से-व्यक्ति या स्रोत-से-व्यक्ति संचरण के अनुमानित अनुक्रम में मामलों को जोड़ना है।

Scope

यह विषय प्रकोप को एक स्रोत से जोड़ने और उसकी संचरण शृंखलाओं का मानचित्रण करने के लिए उपयोग किए जाने वाले तर्क और उपकरणों को शामिल करता है: महामारी वक्र की व्याख्या, बिंदु-स्रोत (point-source) और प्रसारित (propagated) पैटर्न के बीच अंतर, सूचकांक (index) और प्राथमिक मामलों (primary cases) की अवधारणाएँ, प्रजनन संख्या (reproduction number), सुपर-स्प्रेडिंग (super-spreading), और महामारी विज्ञान संबंधी संबंध के साथ रोगज़नक़ जीनोम अनुक्रमण (pathogen genome sequencing) का बढ़ता उपयोग। यह वैचारिक और पद्धतिगत है, किसी विशिष्ट रोगज़नक़ या प्रतिक्रिया के लिए प्रोटोकॉल नहीं है।

Core questions

• प्रकोप एजेंट कहाँ से उत्पन्न हुआ, और किस माध्यम या जलाशय के माध्यम से जोखिम हुआ?
• क्या महामारी वक्र एक बिंदु-स्रोत, सतत, या प्रसारित पैटर्न को इंगित करता है?
• सूचकांक या प्राथमिक मामला कौन है, और किसने किसे संक्रमित किया?
• संबंध की पुष्टि के लिए रोगज़नक़ जीनोम अनुक्रमों को महामारी विज्ञान संबंधी डेटा के साथ कैसे जोड़ा जा सकता है?

Key concepts

• बिंदु-स्रोत बनाम प्रसारित प्रकोप
• सूचकांक मामला और प्राथमिक मामला
• संचरण का तरीका और मार्ग
• मूल और प्रभावी प्रजनन संख्या
• सुपर-स्प्रेडिंग और व्यक्तिगत भिन्नता
• क्रमिक अंतराल और पीढ़ी का समय
• जीनोमिक महामारी विज्ञान और संचरण अनुमान

Mechanisms

महामारी वक्र का आकार स्रोत का पहला सुराग होता है: एक तीव्र एकल शिखर एक सामान्य बिंदु स्रोत का सुझाव देता है, एक निरंतर पठार एक सतत स्रोत का, और क्रमिक अंतराल द्वारा अलग-अलग क्रमिक तरंगें एक प्रसारित, व्यक्ति-से-व्यक्ति प्रसार का। अन्वेषक सामान्य माध्यम या जलाशय तक जोखिमों का पता लगाते हैं और सूचकांक और प्राथमिक मामलों की पहचान करते हैं। संचरण शृंखलाओं को तब समय, स्थान और संपर्क के माध्यम से मामलों को जोड़कर पुनर्निर्मित किया जाता है, और तेजी से रोगज़नक़ जीनोम अनुक्रमों की तुलना करके, क्योंकि निकट संबंधी अनुक्रम एक प्रत्यक्ष महामारी विज्ञान संबंधी संबंध का समर्थन करते हैं। प्रजनन संख्या यह सारांशित करती है कि प्रत्येक मामला औसतन कितने द्वितीयक मामले उत्पन्न करता है, जबकि सुपर-स्प्रेडिंग बड़े व्यक्तिगत भिन्नता को दर्शाती है जो विस्फोटक संचरण को बढ़ावा दे सकती है।

Clinical relevance

स्रोत स्थापित करने से प्रतिक्रियाकर्ताओं को यह पता चलता है कि क्या हटाना है, वापस बुलाना है या बंद करना है, और संचरण शृंखलाओं का मानचित्रण यह दर्शाता है कि संपर्क अनुरेखण और सुरक्षात्मक उपायों को कहाँ निर्देशित करना है। चिकित्सकों के लिए, यह पहचानना कि एक मामला एक शृंखला में एक कड़ी हो सकता है, विस्तृत जोखिम इतिहास और समय पर रिपोर्टिंग के मूल्य को रेखांकित करता है। यह प्रविष्टि बताती है कि स्रोत और प्रसार का अनुमान कैसे लगाया जाता है और यह किसी व्यक्तिगत रोगी के उपचार के लिए मार्गदर्शन नहीं है।

Epidemiology

COVID-19 महामारी की शुरुआत में व्यक्ति-से-व्यक्ति संचरण को एक पारिवारिक समूह के माध्यम से प्रदर्शित किया गया था जिसमें संक्रमण घर के सदस्यों के बीच फैला था, जो सबसे छोटे पैमाने पर शृंखला पुनर्निर्माण को दर्शाता है। जनसंख्या पैमाने पर, SARS महामारी वक्रों के विश्लेषण ने प्रजनन संख्या और नियंत्रण उपायों के प्रभाव का अनुमान लगाया, और सुपर-स्प्रेडिंग के अध्ययनों से पता चला कि मामलों का एक अल्पसंख्यक अधिकांश द्वितीयक संक्रमण उत्पन्न कर सकता है; रोगज़नक़ जीनोम अनुक्रमण अब नियमित रूप से ऐसे महामारी विज्ञान संबंधी संबंध का पूरक है।

History

जॉन स्नो द्वारा उन्नीसवीं शताब्दी में ब्रॉड स्ट्रीट पंप से हैजा के प्रकोप का आरोपण, मामलों को एक सामान्य जोखिम से जोड़ने द्वारा स्रोत पहचान का एक आदर्श उदाहरण है। बीसवीं शताब्दी के क्षेत्र महामारी विज्ञान ने महामारी वक्र की व्याख्या और बिंदु-स्रोत बनाम प्रसारित भेद को औपचारिक रूप दिया, जबकि इक्कीसवीं शताब्दी ने मात्रात्मक संचरण मॉडलिंग, SARS से सुपर-स्प्रेडिंग की पहचान, और पूरे-जीनोम अनुक्रमण को जोड़ा, जिसने मिलकर संचरण शृंखलाओं के पुनर्निर्माण को तेज किया।

Debates

क्या केवल जीनोम अनुक्रम ही यह स्थापित कर सकते हैं कि किसने किसे संक्रमित किया?

रोगज़नक़ जीनोमिक डेटा संचरण अनुमान को बहुत मजबूत करता है, लेकिन सीमित अंतः-होस्ट विविधता, साझा स्रोत और नमूनाकरण अंतराल का मतलब है कि अनुक्रम आमतौर पर प्रत्यक्ष संबंध को निश्चित रूप से साबित करने के बजाय उसे बाधित करते हैं, इसलिए जीनोमिक और महामारी विज्ञान संबंधी साक्ष्य को सर्वोत्तम रूप से जोड़ा जाता है।

Key figures

• Jacco Wallinga
• James Lloyd-Smith
• Marc Lipsitch
• Yonatan Grad

Seminal works

• wallinga-teunis-2004
• lloyd-smith-2005
• grad-lipsitch-2014

Frequently asked questions

महामारी वक्र का आकार अन्वेषकों को स्रोत के बारे में क्या बताता है?

एकल तीव्र शिखर एक सामान्य बिंदु स्रोत का सुझाव देता है, एक लंबा पठार एक सतत स्रोत का सुझाव देता है, और बीमारी के क्रमिक अंतराल द्वारा अलग-अलग उत्तरोत्तर बड़ी तरंगों की एक श्रृंखला प्रसारित व्यक्ति-से-व्यक्ति संचरण का सुझाव देती है।

सुपर-स्प्रेडिंग क्या है?

सुपर-स्प्रेडिंग व्यक्तियों के बीच इस बात में बड़े अंतर का वर्णन करता है कि वे कितने द्वितीयक संक्रमणों का कारण बनते हैं; मामलों या घटनाओं की एक छोटी संख्या संचरण के एक असमान हिस्से के लिए जिम्मेदार हो सकती है, जो इस बात को दृढ़ता से आकार देती है कि प्रकोप कैसे बढ़ते हैं और उन्हें कैसे नियंत्रित किया जा सकता है।