شناسایی قارچ و آزمایش ضد قارچ

شناسایی قارچ و آزمایش ضد قارچ، روش‌های آزمایشگاهی هستند که مخمرها و کپک‌های عامل عفونت انسانی را شناسایی و نام‌گذاری می‌کنند و حساسیت آن‌ها را به عوامل ضد قارچ اندازه‌گیری می‌کنند. قارچ‌شناسی تشخیصی، میکروسکوپ و کشت را با تشخیص آنتی‌ژن و آنتی‌بادی، روش‌های مولکولی و شناسایی پروتئومیک ترکیب می‌کند و آزمایش حساسیت آزمایشگاهی (in vitro) را برای عوامل ضد قارچ اضافه می‌کند.

Definition

شناسایی قارچ، تعیین آزمایشگاهی گونه یک مخمر یا کپک از یک نمونه بالینی، با استفاده از روش‌های میکروسکوپی، کشت، سرولوژی، مولکولی یا پروتئومیک است؛ آزمایش ضد قارچ، اندازه‌گیری آزمایشگاهی (in vitro) حساسیت یک جدایه قارچی به عوامل ضد قارچ است.

Scope

این مدخل شامل میکروسکوپ مستقیم و کشت، تشخیص آنتی‌ژن و آنتی‌بادی (سرولوژیک)، شناسایی نوکلئیک اسید و پروتئومیک قارچ‌ها، و آزمایش حساسیت ضد قارچ با نقاط برش تفسیری آن است. این موارد را به عنوان روش‌های آزمایشگاهی مورد بررسی قرار می‌دهد و انتخاب یا دوز داروهای ضد قارچ را برای بیماران ارائه نمی‌دهد.

Core questions

• آیا قارچی در این نمونه وجود دارد و گونه آن چیست؟
• کدام روش‌ها - میکروسکوپ، کشت، تشخیص آنتی‌ژن یا آنتی‌بادی، سنجش‌های مولکولی، یا طیف‌سنجی جرمی - آن را بهتر شناسایی و تشخیص می‌دهند؟
• آیا جدایه به عوامل ضد قارچ مربوطه حساس است و چگونه این اندازه‌گیری و تفسیر می‌شود؟
• محدودیت‌های تشخیص قارچ در حساسیت، سرعت و استانداردسازی چیست؟

Key concepts

• میکروسکوپ مستقیم (KOH، کالکوفلور، هیستوپاتولوژی)
• کشت و مورفولوژی قارچ
• تشخیص آنتی‌ژن (مانند گالاکتومانان، آنتی‌ژن کریپتوکوکی، بتا-دی-گلوکان)
• آزمایش آنتی‌بادی (سرولوژیک)
• شناسایی مولکولی و پروتئومیک
• طیف‌سنجی جرمی MALDI-TOF قارچ‌ها
• آزمایش حساسیت ضد قارچ و نقاط برش
• مخمرها در مقابل کپک‌ها

Mechanisms

قارچ‌شناسی تشخیصی، قارچ‌ها را با مشاهده آن‌ها در نمونه‌ها با رنگ‌آمیزی و میکروسکوپ، با رشد آن‌ها در کشت و خواندن مورفولوژی کلنی و میکروسکوپی، و با روش‌های مستقل از کشت شناسایی می‌کند. سنجش‌های آنتی‌ژن، اجزای دیواره سلولی یا کپسولی قارچی در گردش را شناسایی می‌کنند، در حالی که آزمایش‌های آنتی‌بادی، پاسخ میزبان را شناسایی می‌کنند؛ این‌ها همراه با سنجش‌های مولکولی و شناسایی پروتئومیک، شناسایی را به ارگانیسم‌هایی که کند رشد می‌کنند یا کشت آن‌ها دشوار است، گسترش می‌دهند (Kozel & Wickes, 2014). شناسایی در سطح گونه به طور فزاینده‌ای از طیف‌سنجی جرمی MALDI-TOF استفاده می‌کند که طیف پروتئینی یک جدایه قارچی را با یک پایگاه داده مرجع مطابقت می‌دهد (Clark et al., 2013). سپس آزمایش حساسیت ضد قارچ، فعالیت مهاری عوامل ضد قارچ را در برابر یک جدایه اندازه‌گیری می‌کند و آن را در برابر نقاط برش تفسیر می‌کند؛ استانداردسازی این آزمایش و ارتباط آن با نتایج، تلاشی در حال تکامل بوده است (Rex & Pfaller, 2002). دستورالعمل‌های حرفه‌ای این روش‌های آزمایشگاهی را در ارزیابی تشخیصی گسترده‌تر بیماری قارچی قرار می‌دهند (Pappas et al., 2016).

Clinical relevance

نتایج شناسایی قارچ و حساسیت به درمان، به استدلال بالینی در مورد عفونت‌های قارچی مهاجم و سطحی کمک می‌کند و به مدیریت عوامل ضد قارچ اطلاعات می‌دهد. این مدخل نحوه تولید و تفسیر این نتایج آزمایشگاهی را توضیح می‌دهد؛ این یک ماده مرجع است و مبنایی برای انتخاب یا دوز درمانی ضد قارچ برای یک فرد نیست، که توسط دستورالعمل‌های بالینی و تیم درمانی مورد بررسی قرار می‌گیرد.

Epidemiology

قارچ‌شناسی تشخیصی از نظارت بر پاتوژن‌های قارچی و مقاومت ضد قارچی در حال ظهور، از جمله تغییرات در گونه‌های مسئول عفونت‌هایی مانند کاندیدیازیس، حمایت می‌کند. اسناد راهنما نشان می‌دهند که چگونه تشخیص‌های آزمایشگاهی و داده‌های حساسیت به درمان، مدیریت را در سطح جمعیت و فردی اطلاع‌رسانی می‌کنند (Pappas et al., 2016).

History

تشخیص قارچ‌شناسی مدت‌ها به میکروسکوپ و کشت آهسته با شناسایی مورفولوژیک وابسته بود. سنجش‌های آنتی‌ژن و آنتی‌بادی، سپس روش‌های مولکولی و پروتئومیک، شناسایی را گسترش و سرعت بخشیدند (Kozel & Wickes, 2014)، در حالی که آزمایش حساسیت ضد قارچ از یک ابزار تحقیقاتی به سمت یک سنجش بالینی استاندارد در اواخر قرن بیستم و اوایل قرن بیست و یکم تکامل یافت (Rex & Pfaller, 2002).

Seminal works

• kozel-2014
• rex-2002
• pappas-2016

Frequently asked questions

چگونه قارچ‌ها زمانی که کشت کند یا منفی است، شناسایی می‌شوند؟

آزمایشگاه‌ها از روش‌های مستقل از کشت - سنجش‌های آنتی‌ژن (مانند آنتی‌ژن کریپتوکوکی، گالاکتومانان، یا بتا-دی-گلوکان)، آزمایش‌های آنتی‌بادی، و سنجش‌های مولکولی - برای شناسایی قارچ‌هایی که به کندی رشد می‌کنند یا نمی‌توانند از یک نمونه مشخص کشت شوند، استفاده می‌کنند (Kozel & Wickes, 2014).

آزمایش حساسیت ضد قارچ چیست؟

این اندازه‌گیری آزمایشگاهی (in vitro) است که نشان می‌دهد آیا یک عامل ضد قارچ یک جدایه قارچی را مهار می‌کند یا خیر، که در برابر نقاط برش تفسیر می‌شود. استانداردسازی این آزمایش و ارتباط آن با نتایج بالینی یک فرآیند تدریجی بوده است (Rex & Pfaller, 2002).